75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3982 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3982  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  100 
 
 		 293 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4248  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  82.65 
 
 		 294 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1334  Alpha/beta hydrolase fold  65.65 
 
 		 294 aa  394  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1408  alpha/beta hydrolase fold  63.87 
 
 		 295 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.598825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4315  alpha/beta hydrolase fold  63.5 
 
 		 295 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0387901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4403  alpha/beta hydrolase fold  63.64 
 
 		 295 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1049  alpha/beta hydrolase fold  63.14 
 
 		 296 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54830  putative transferase  55.11 
 
 		 300 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103759  unclonable  4.60495e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4793  transferase  55.47 
 
 		 300 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1354  alpha/beta hydrolase fold  50.37 
 
 		 295 aa  292  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3129  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  45.39 
 
 		 287 aa  269  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3299  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  48.35 
 
 		 258 aa  248  6e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.242823  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2396  alpha/beta hydrolase fold protein  40.81 
 
 		 272 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19100  rhamnosyltransferase chain A  42.14 
 
 		 295 aa  231  9e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0158051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1647  rhamnosyltransferase chain A  42.75 
 
 		 295 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1021  rhamnosyltransferase I, subunit A  39.58 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149515  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0184  rhamnosyltransferase I, subunit A  39.58 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.252928  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0810  rhamnosyltransferase I, subunit A  39.58 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000408122  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1921  rhamnosyltransferase 1 subunit A  39.58 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000117778  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0459  rhamnosyltransferase I, subunit A  39.58 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000126343  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0919  rhamnosyltransferase 1, subunit A  39.58 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0298051  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1075  rhamnosyltransferase 1, subunit A  39.72 
 
 		 299 aa  221  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000547934  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1881  rhamnosyltransferase 1, subunit A  39.72 
 
 		 299 aa  221  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000281436  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1834  rhamnosyltransferase I, subunit A  39.22 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0965522  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0723  rhamnosyltransferase I, subunit A  39.22 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197739  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2094  rhamnosyltransferase 1, subunit A  39.22 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000000939579  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0374  rhamnosyltransferase 1, subunit A  39.22 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000541309  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1995  rhamnosyltransferase I, subunit A  40.77 
 
 		 278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000145905  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1423  rhamnosyltransferase I, subunit A  40.77 
 
 		 278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.025995  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0463  rhamnosyltransferase I, subunit A  40.77 
 
 		 278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0724  rhamnosyltransferase I, subunit A  40.77 
 
 		 278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152501  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5034  alpha/beta hydrolase fold  39.34 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4509  alpha/beta hydrolase fold  39.34 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2296  alpha/beta hydrolase fold protein  40.15 
 
 		 272 aa  212  7e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5097  alpha/beta hydrolase  38.6 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3271  alpha/beta hydrolase  38.6 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5185  alpha/beta hydrolase  38.6 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0312976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0556  Alpha/beta hydrolase  38.24 
 
 		 300 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2287  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  36.47 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  22.95 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  22.26 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  22.63 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  21.49 
 
 		 259 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  23.84 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1101  putative hydrolase  21.69 
 
 		 407 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  22.03 
 
 		 258 aa  50.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  23.47 
 
 		 277 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  21.14 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2149  alpha/beta hydrolase fold  21.78 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  22.31 
 
 		 264 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0068  streptothricin acetyltransferase Sat-1  23.88 
 
 		 336 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470432  normal  0.337184 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  22.73 
 
 		 261 aa  46.2  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0133  streptothricin acetyltransferase Sat-1  23.88 
 
 		 359 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  21.94 
 
 		 259 aa  45.8  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  22.09 
 
 		 265 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  19.2 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  23.4 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2890  hydrolase  27.1 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3091  proline iminopeptidase  25.68 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  19.2 
 
 		 266 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  19.92 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  27.64 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  21.03 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  19.2 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11990  putative hydrolase  20.57 
 
 		 407 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  23.4 
 
 		 279 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  27.64 
 
 		 270 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4596  alpha/beta hydrolase fold protein  25.21 
 
 		 260 aa  42.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  27.42 
 
 		 318 aa  42.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  22.3 
 
 		 298 aa  42.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  23.75 
 
 		 279 aa  42.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  18.8 
 
 		 311 aa  42.4  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  19.29 
 
 		 258 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>