171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4793 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4793  transferase  100 
 
 
300 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54830  putative transferase  92.33 
 
 
300 aa  583  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103759  unclonable  4.60495e-22 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1354  alpha/beta hydrolase fold  61.76 
 
 
295 aa  358  5e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1408  alpha/beta hydrolase fold  59.66 
 
 
295 aa  358  7e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.598825  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4403  alpha/beta hydrolase fold  60 
 
 
295 aa  358  7e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354614  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4315  alpha/beta hydrolase fold  59.66 
 
 
295 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0387901  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1049  alpha/beta hydrolase fold  62.04 
 
 
296 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1334  Alpha/beta hydrolase fold  57.66 
 
 
294 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4248  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  54.9 
 
 
294 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3982  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  55.47 
 
 
293 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3129  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  48.23 
 
 
287 aa  295  8e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3299  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  50.4 
 
 
258 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.242823  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0810  rhamnosyltransferase I, subunit A  43.17 
 
 
299 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000408122  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1921  rhamnosyltransferase 1 subunit A  43.17 
 
 
299 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000117778  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0459  rhamnosyltransferase I, subunit A  42.81 
 
 
299 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000126343  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0919  rhamnosyltransferase 1, subunit A  42.81 
 
 
299 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0298051  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0374  rhamnosyltransferase 1, subunit A  42.81 
 
 
299 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000541309  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2094  rhamnosyltransferase 1, subunit A  42.81 
 
 
299 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000000939579  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0184  rhamnosyltransferase I, subunit A  42.81 
 
 
299 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.252928  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1021  rhamnosyltransferase I, subunit A  42.81 
 
 
299 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149515  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0723  rhamnosyltransferase I, subunit A  42.81 
 
 
299 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197739  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1834  rhamnosyltransferase I, subunit A  42.81 
 
 
299 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0965522  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1075  rhamnosyltransferase 1, subunit A  43.17 
 
 
299 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000547934  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1881  rhamnosyltransferase 1, subunit A  43.17 
 
 
299 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000281436  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1647  rhamnosyltransferase chain A  44.73 
 
 
295 aa  234  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19100  rhamnosyltransferase chain A  44.36 
 
 
295 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0158051 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0463  rhamnosyltransferase I, subunit A  44.62 
 
 
278 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0724  rhamnosyltransferase I, subunit A  44.62 
 
 
278 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152501  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1423  rhamnosyltransferase I, subunit A  44.62 
 
 
278 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.025995  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1995  rhamnosyltransferase I, subunit A  44.62 
 
 
278 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000145905  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5185  alpha/beta hydrolase  44.12 
 
 
300 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0312976  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3271  alpha/beta hydrolase  44.12 
 
 
300 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5097  alpha/beta hydrolase  44.12 
 
 
300 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5034  alpha/beta hydrolase fold  43.38 
 
 
300 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4509  alpha/beta hydrolase fold  43.38 
 
 
300 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273476  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0556  Alpha/beta hydrolase  43.38 
 
 
300 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2296  alpha/beta hydrolase fold protein  42.34 
 
 
272 aa  223  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2396  alpha/beta hydrolase fold protein  38.97 
 
 
272 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2287  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  35.51 
 
 
292 aa  158  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  24.81 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  23.6 
 
 
269 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
273 aa  59.3  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 
268 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
273 aa  57  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  24.39 
 
 
313 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  25.19 
 
 
313 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 
261 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  23.46 
 
 
263 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  24.16 
 
 
299 aa  53.9  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  24.59 
 
 
258 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  24.47 
 
 
261 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  24.47 
 
 
261 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  24.47 
 
 
261 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  22.42 
 
 
270 aa  52.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0431  proline iminopeptidase  21.81 
 
 
318 aa  52.8  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  22.42 
 
 
270 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  23.55 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4965  proline iminopeptidase  24.74 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328745  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  22.08 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3551  proline iminopeptidase  21.88 
 
 
328 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  24.21 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  25.63 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  23.49 
 
 
264 aa  50.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  24.79 
 
 
261 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  26.88 
 
 
321 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0887  prolyl aminopeptidase  27.52 
 
 
320 aa  49.7  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  23.83 
 
 
268 aa  49.7  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  24.17 
 
 
285 aa  49.3  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  22.56 
 
 
297 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  23.6 
 
 
261 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1435  alpha/beta hydrolase fold  23.32 
 
 
253 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.458489  normal  0.862062 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  23.9 
 
 
263 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 
277 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  23.6 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5863  alpha/beta hydrolase fold protein  27.19 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1728  proline iminopeptidase  27.86 
 
 
436 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2193  proline iminopeptidase  28.08 
 
 
414 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  23.55 
 
 
263 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2907  prolyl aminopeptidase  21.58 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  21.83 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  25.91 
 
 
261 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  27.86 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  25.88 
 
 
279 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  24.63 
 
 
267 aa  47.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0886  proline iminopeptidase  27.86 
 
 
429 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424986  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1173  proline iminopeptidase  27.86 
 
 
429 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0373  proline iminopeptidase  27.86 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0279  proline iminopeptidase  27.86 
 
 
429 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237584  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2151  proline iminopeptidase  27.86 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  22.79 
 
 
270 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2890  hydrolase  26.09 
 
 
294 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  26.27 
 
 
279 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1101  putative hydrolase  24.39 
 
 
407 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2349  prolyl aminopeptidase  21.18 
 
 
319 aa  46.6  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34102  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  23.02 
 
 
256 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  23.02 
 
 
256 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2767  proline iminopeptidase  26.57 
 
 
322 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1664  polyketide synthase, putative  27.2 
 
 
2082 aa  46.2  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685154  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
267 aa  45.8  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>