192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2296 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2296  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 272 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2396  alpha/beta hydrolase fold protein  56.46 
 
 		 272 aa  333  3e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1049  alpha/beta hydrolase fold  45.26 
 
 		 296 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1408  alpha/beta hydrolase fold  44.89 
 
 		 295 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.598825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0556  Alpha/beta hydrolase  43.38 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4403  alpha/beta hydrolase fold  44.89 
 
 		 295 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4315  alpha/beta hydrolase fold  44.53 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0387901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5185  alpha/beta hydrolase  43.01 
 
 		 300 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0312976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3129  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  43.54 
 
 		 287 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3271  alpha/beta hydrolase  43.01 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5097  alpha/beta hydrolase  43.01 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0810  rhamnosyltransferase I, subunit A  41.54 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000408122  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1921  rhamnosyltransferase 1 subunit A  41.54 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000117778  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5034  alpha/beta hydrolase fold  41.54 
 
 		 300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1075  rhamnosyltransferase 1, subunit A  41.18 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000547934  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1881  rhamnosyltransferase 1, subunit A  41.18 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000281436  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4509  alpha/beta hydrolase fold  41.54 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273476  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0459  rhamnosyltransferase I, subunit A  41.18 
 
 		 299 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000126343  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0919  rhamnosyltransferase 1, subunit A  41.18 
 
 		 299 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0298051  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0184  rhamnosyltransferase I, subunit A  41.18 
 
 		 299 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.252928  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1021  rhamnosyltransferase I, subunit A  41.18 
 
 		 299 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149515  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0374  rhamnosyltransferase 1, subunit A  41.18 
 
 		 299 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000541309  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2094  rhamnosyltransferase 1, subunit A  41.18 
 
 		 299 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000000939579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0723  rhamnosyltransferase I, subunit A  41.18 
 
 		 299 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197739  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1834  rhamnosyltransferase I, subunit A  41.18 
 
 		 299 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0965522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19100  rhamnosyltransferase chain A  42.37 
 
 		 295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0158051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1647  rhamnosyltransferase chain A  41.98 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3299  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  46.69 
 
 		 258 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.242823  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54830  putative transferase  43.43 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103759  unclonable  4.60495e-22 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0463  rhamnosyltransferase I, subunit A  41.6 
 
 		 278 aa  225  7e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0724  rhamnosyltransferase I, subunit A  41.6 
 
 		 278 aa  225  7e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152501  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1423  rhamnosyltransferase I, subunit A  41.6 
 
 		 278 aa  225  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.025995  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1995  rhamnosyltransferase I, subunit A  41.6 
 
 		 278 aa  225  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000145905  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4793  transferase  42.34 
 
 		 300 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1334  Alpha/beta hydrolase fold  42.53 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3982  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  40.15 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1354  alpha/beta hydrolase fold  40.31 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4248  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  38.55 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2287  3-hydroxyacyl-CoA-acyl carrier protein transferase  38.46 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  23.64 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  24.11 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  23.93 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  23.57 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  24.18 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  22.18 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  19.92 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  22.27 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  20.42 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  22.47 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  22.86 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  21.24 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  20.7 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1101  putative hydrolase  21.53 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  20.88 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  21.89 
 
 		 462 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  23.76 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  19.76 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  23.05 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5863  alpha/beta hydrolase fold protein  23.53 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  20.68 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  22.87 
 
 		 345 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  21.8 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  41.38 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  25 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  23.58 
 
 		 262 aa  52.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  20.58 
 
 		 269 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  23.6 
 
 		 275 aa  52.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  20.24 
 
 		 275 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  22.66 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  21.29 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20960  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  23.05 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  23.26 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  24.39 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  22.73 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2149  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 227 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5821  alpha/beta hydrolase fold protein  24.08 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.726094  decreased coverage  0.00151832 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3629  Alpha/beta hydrolase fold  23.48 
 
 		 292 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.611576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  21.97 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  25.21 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  20.6 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01088  hypothetical esterase/lipase ybfF  23.71 
 
 		 230 aa  50.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000642463  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  24.71 
 
 		 267 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  22.26 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  19.92 
 
 		 262 aa  49.7  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  21.81 
 
 		 271 aa  49.7  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  24.59 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  23.22 
 
 		 267 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  24.15 
 
 		 263 aa  49.3  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 263 aa  49.3  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  23.48 
 
 		 277 aa  49.3  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 		 252 aa  49.3  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  23.33 
 
 		 265 aa  48.9  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  22.54 
 
 		 453 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  21.83 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  17.48 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  22.78 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  18.27 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4297  alpha/beta hydrolase fold  24.06 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32686  normal  0.261339 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>