More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0833 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0833  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 287 aa  559  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.62 
 
 		 402 aa  256  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.31 
 
 		 393 aa  208  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.31 
 
 		 393 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.31 
 
 		 393 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.31 
 
 		 393 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.31 
 
 		 393 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  53.88 
 
 		 393 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0618  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.21 
 
 		 400 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  44.62 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4075  alpha/beta hydrolase fold  44.91 
 
 		 272 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  41.5 
 
 		 393 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  44.94 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  37.9 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  36.33 
 
 		 260 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  38.1 
 
 		 397 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  38.8 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  37.97 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  37.97 
 
 		 256 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  37.97 
 
 		 256 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  42.17 
 
 		 391 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  37.25 
 
 		 393 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  34.82 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  39.11 
 
 		 260 aa  132  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  36.03 
 
 		 265 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0302  carboxymuconolactone decarboxylase  36 
 
 		 389 aa  129  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0830882  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  34.41 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  34.78 
 
 		 393 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  35.95 
 
 		 269 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  34.52 
 
 		 261 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  35.1 
 
 		 396 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  34.4 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  37.08 
 
 		 262 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  35.22 
 
 		 425 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  33.6 
 
 		 261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  34 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  34.93 
 
 		 259 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  33.6 
 
 		 261 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  32.43 
 
 		 269 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.2 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  34 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  34 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  34 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  32.55 
 
 		 282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  34.29 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.29 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  34.29 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  34.29 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  34.29 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  32.92 
 
 		 258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  34.29 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  28.51 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  32.32 
 
 		 360 aa  113  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  32.52 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  32.54 
 
 		 270 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  33.6 
 
 		 270 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  32.54 
 
 		 270 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  33.46 
 
 		 392 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  33.64 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  34.69 
 
 		 262 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  30.52 
 
 		 275 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  32.05 
 
 		 265 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  31.13 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  34.01 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  30.2 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  33.19 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  32.02 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  31.15 
 
 		 267 aa  105  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  30.45 
 
 		 263 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  30.36 
 
 		 255 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  35.25 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  30.92 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  32.79 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  35.47 
 
 		 397 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  32.78 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  30.12 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.59 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  31.85 
 
 		 262 aa  102  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2233  3-oxoadipate enol-lactonase  30.25 
 
 		 300 aa  102  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  34.66 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3040  3-oxoadipate enol-lactonase  34.82 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  30.61 
 
 		 263 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  33.19 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  28.63 
 
 		 263 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  31.84 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2904  3-oxoadipate enol-lactonase  34.8 
 
 		 377 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475956  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  32.65 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  33.19 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  31.08 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  29.1 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  32.37 
 
 		 279 aa  99.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  32.44 
 
 		 254 aa  99.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  29.36 
 
 		 260 aa  99  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.36 
 
 		 260 aa  99  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 279 aa  99  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>