248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2862 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2862  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 271 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  53.74 
 
 		 266 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4372  alpha/beta family hydrolase  49.15 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.686172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2949  alpha/beta hydrolase fold  43.49 
 
 		 271 aa  208  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.545682  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  42.57 
 
 		 257 aa  199  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0879  alpha/beta hydrolase fold  42.7 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  0.445527 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0882  hypothetical protein  43.58 
 
 		 276 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  48.28 
 
 		 255 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0215  alpha/beta hydrolase  42.38 
 
 		 271 aa  191  9e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296554  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0897  putative lactonase (box pathway)  42.29 
 
 		 287 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0425746  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1544  alpha/beta hydrolase fold protein  44.73 
 
 		 284 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  40.4 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 280 aa  182  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  40.53 
 
 		 272 aa  181  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1328  Alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  41.42 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2701  alpha/beta hydrolase fold  41.53 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3026  hypothetical protein  44.83 
 
 		 277 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  42.13 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4734  alpha/beta hydrolase fold  41.63 
 
 		 264 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.590817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0748  alpha/beta family hydrolase  42.19 
 
 		 267 aa  178  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4655  Alpha/beta hydrolase  39.92 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  41.7 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5009  alpha/beta hydrolase fold  41.3 
 
 		 288 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.97318  normal  0.569979 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3602  alpha/beta hydrolase fold  41.74 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  40.31 
 
 		 273 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  40.25 
 
 		 265 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  40.25 
 
 		 265 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3803  alpha/beta hydrolase fold  40.43 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0322  lactonase  38.27 
 
 		 277 aa  165  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1225  alpha/beta hydrolase fold  40.08 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16662  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4108  alpha/beta hydrolase fold  37.01 
 
 		 270 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  37.01 
 
 		 270 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0670  alpha/beta hydrolase  42.13 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0554  lactonase  37.99 
 
 		 390 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0377  alpha/beta fold family hydrolase  38.43 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0364  alpha/beta fold family hydrolase  37.99 
 
 		 277 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4964  alpha/beta hydrolase fold  38.33 
 
 		 275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1771  alpha/beta hydrolase fold protein  37.34 
 
 		 279 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3299  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  37.28 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4621  alpha/beta hydrolase fold  38.49 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1010  alpha/beta family hydrolase  42.46 
 
 		 176 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  33.2 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 		 270 aa  62  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  28.07 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 		 312 aa  58.9  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  26.88 
 
 		 313 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  26.45 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  24.11 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  28.5 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  25.32 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 		 309 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  23.76 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  26.2 
 
 		 268 aa  52.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  26.26 
 
 		 313 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  28.02 
 
 		 279 aa  52.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  27.72 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  22.22 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  26.44 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  32.09 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  20.35 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  30.4 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  26.71 
 
 		 299 aa  50.4  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  25.96 
 
 		 296 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  23.95 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237751 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  31.03 
 
 		 294 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 		 275 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1559  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 		 284 aa  48.9  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0478161  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 285 aa  48.9  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  35.59 
 
 		 324 aa  49.3  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  26.39 
 
 		 319 aa  48.9  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  29.67 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  26.28 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 346 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>