More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0882 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0882  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  556  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  70.04 
 
 
272 aa  368  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2949  alpha/beta hydrolase fold  67.18 
 
 
271 aa  363  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.545682  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  66.67 
 
 
267 aa  360  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  65.89 
 
 
280 aa  355  5.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0215  alpha/beta hydrolase  64.02 
 
 
271 aa  349  3e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296554  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1328  Alpha/beta hydrolase fold  60.38 
 
 
271 aa  319  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1225  alpha/beta hydrolase fold  59.16 
 
 
271 aa  310  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16662  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1544  alpha/beta hydrolase fold protein  55.26 
 
 
284 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0897  putative lactonase (box pathway)  56.45 
 
 
287 aa  298  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0425746  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  57.26 
 
 
282 aa  297  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2701  alpha/beta hydrolase fold  56.8 
 
 
284 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832615  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  49.8 
 
 
257 aa  239  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4655  Alpha/beta hydrolase  47.13 
 
 
273 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4372  alpha/beta family hydrolase  50.63 
 
 
270 aa  203  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.686172 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  46.96 
 
 
273 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0879  alpha/beta hydrolase fold  46.28 
 
 
273 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  0.445527 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3026  hypothetical protein  47.35 
 
 
277 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  45.26 
 
 
266 aa  192  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  41.2 
 
 
255 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0748  alpha/beta family hydrolase  41.92 
 
 
267 aa  188  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2862  Alpha/beta hydrolase fold  42.75 
 
 
271 aa  182  7e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4734  alpha/beta hydrolase fold  40.65 
 
 
264 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.590817  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0670  alpha/beta hydrolase  37.55 
 
 
258 aa  156  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3803  alpha/beta hydrolase fold  39.66 
 
 
265 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  38.93 
 
 
265 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  38.93 
 
 
265 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4621  alpha/beta hydrolase fold  37.68 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3602  alpha/beta hydrolase fold  39.32 
 
 
280 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  39.92 
 
 
285 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1771  alpha/beta hydrolase fold protein  38.43 
 
 
279 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  38.98 
 
 
286 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4108  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5009  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 
288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.97318  normal  0.569979 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 
270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0377  alpha/beta fold family hydrolase  37.82 
 
 
277 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0554  lactonase  37.39 
 
 
390 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0364  alpha/beta fold family hydrolase  37.39 
 
 
277 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1010  alpha/beta family hydrolase  43.71 
 
 
176 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 
275 aa  132  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0322  lactonase  35.15 
 
 
277 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4964  alpha/beta hydrolase fold  33.48 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102964  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3299  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  24.55 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  23.36 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  23.27 
 
 
299 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  30.49 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  26.09 
 
 
278 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  28.88 
 
 
296 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 
275 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  23.28 
 
 
344 aa  59.7  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  25.72 
 
 
456 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1477  proline iminopeptidase like protein  23.1 
 
 
297 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  22.97 
 
 
336 aa  57  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 
270 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  29.22 
 
 
255 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.72 
 
 
284 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  27.21 
 
 
279 aa  56.6  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  28.64 
 
 
270 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  28.64 
 
 
270 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
431 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 
344 aa  55.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  26.18 
 
 
283 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1973  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
243 aa  55.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  24.76 
 
 
278 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 
284 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  28.64 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 
296 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
285 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 
363 aa  53.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0631  alpha/beta fold family hydrolase  28.15 
 
 
267 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
284 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  22.81 
 
 
296 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
277 aa  53.1  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 
265 aa  52.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.68 
 
 
343 aa  52.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6488  Alpha/beta hydrolase  26.42 
 
 
271 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  22.69 
 
 
258 aa  52.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 
265 aa  52.4  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 
271 aa  52  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
293 aa  52  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  22.92 
 
 
296 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  25.57 
 
 
303 aa  52.4  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
339 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  25.63 
 
 
315 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0016  alpha/beta hydrolase fold protein  23.39 
 
 
288 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  22.92 
 
 
296 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  25.63 
 
 
315 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  22.94 
 
 
289 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2037  Alpha/beta hydrolase fold  23.65 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  29.63 
 
 
328 aa  50.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  23.72 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  25.66 
 
 
265 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  22.92 
 
 
296 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>