More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5637 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  100 
 
 		 297 aa  622  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4217  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  68.71 
 
 		 307 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4540  proline iminopeptidase, putative  67.91 
 
 		 316 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6197  proline-specific peptidase  64.07 
 
 		 300 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.941686 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  65.1 
 
 		 300 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2180  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  62.24 
 
 		 299 aa  393  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2123  Prolyl aminopeptidase  59.79 
 
 		 300 aa  371  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02210  proline imino-peptidase  60.27 
 
 		 313 aa  359  3e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  54.48 
 
 		 306 aa  333  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2685  proline-specific peptidase  50.68 
 
 		 296 aa  305  4.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.492833  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  51.57 
 
 		 319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1477  proline iminopeptidase like protein  42.31 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  35.96 
 
 		 287 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.348936 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  35.82 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  36.52 
 
 		 292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2163  proline-specific peptidase  36.6 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10858  proline iminopeptidase pip  34.94 
 
 		 286 aa  165  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000563068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  33.91 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.094773 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11350  proline-specific peptidase  32.88 
 
 		 295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  35.09 
 
 		 296 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16440  proline-specific peptidase  33.45 
 
 		 298 aa  162  9e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.700734 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  34.72 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21290  proline-specific peptidase  33.11 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24200  proline-specific peptidase  33.22 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1849  prolyl aminopeptidase  31.12 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000467937  hitchhiker  0.000191217 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2662  proline-specific peptidase  30.64 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000838232  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1984  proline-specific peptidase  25.52 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3362  proline-specific peptidase  28.33 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.158182 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0261  proline-specific peptidase  28.43 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3901  proline-specific peptidase  27.46 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0490645 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0052  prolyl aminopeptidase  28.12 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.946601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0035  proline-specific peptidase  30.51 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0847997  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1648  proline-specific peptidase  27.43 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0830  proline-specific peptidase  26.35 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.269781  unclonable  0.00000881628 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0576  tricorn interacting factor F1  26.91 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  29.35 
 
 		 302 aa  86.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0241  alpha/beta fold family hydrolase  25.09 
 
 		 292 aa  85.9  8e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.77 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  26.22 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  24.4 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48133  predicted protein  23.4 
 
 		 360 aa  72.4  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0537901  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40124  predicted protein  26.01 
 
 		 345 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.277877  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  22.34 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  21.26 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1064  tricorn interacting factor F1  24.83 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.55 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  24.45 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.8 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  21.63 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  25.61 
 
 		 262 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  23.72 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  24.45 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  26.37 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_93830  predicted protein  24.81 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5137  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  28.42 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  22.79 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  23.1 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  26.37 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  23.99 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  25.48 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  26.83 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  27.14 
 
 		 425 aa  59.7  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  26.6 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  31.13 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  22.87 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 262 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  22.34 
 
 		 278 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1531  alpha/beta hydrolase fold protein  33.65 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.895965  normal  0.548298 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  24.92 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  24.56 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  23.91 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0193  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.21 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2148  alpha/beta fold family hydrolase  21.03 
 
 		 343 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.014973  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  26.61 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  22.92 
 
 		 277 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 290 aa  57  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>