292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0973 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0973  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
347 aa  719    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000354687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2226  alpha/beta fold family hydrolase  54.94 
 
 
343 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2148  alpha/beta fold family hydrolase  54.65 
 
 
343 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.014973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2392  alpha/beta fold family hydrolase  54.94 
 
 
343 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0864957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2422  alpha/beta fold family hydrolase  53.78 
 
 
343 aa  375  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.157324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2198  alpha/beta hydrolase fold  52.75 
 
 
343 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00385806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2164  alpha/beta hydrolase  53.78 
 
 
343 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2409  hydrolase, alpha/beta fold family  53.78 
 
 
343 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2801  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 
332 aa  162  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3934  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 
332 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.870458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3858  prolyl aminopeptidase  29.27 
 
 
332 aa  156  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4011  alpha/beta fold family hydrolase  29.27 
 
 
332 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3844  prolyl aminopeptidase  29.27 
 
 
332 aa  155  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4126  putative hydrolase, alpha/beta fold family  29.27 
 
 
332 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00083972 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4324  alpha/beta fold family hydrolase  29.27 
 
 
332 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1200  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
364 aa  154  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4171  alpha/beta fold family hydrolase  28.79 
 
 
332 aa  153  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4235  putative hydrolase, alpha/beta fold family  29.09 
 
 
332 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4212  putative hydrolase, alpha/beta fold family  30 
 
 
332 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20570  alpha/beta hydrolase fold protein  30.97 
 
 
363 aa  149  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1025  putative hydrolase, alpha/beta fold family  29.75 
 
 
332 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0501  alpha/beta hydrolase fold protein  32.51 
 
 
378 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1582  Alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 
376 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4164  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 
356 aa  139  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  27.15 
 
 
364 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1084  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
335 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.63067  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4419  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 
399 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.582229  normal  0.372362 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4017  proline imino-peptidase  26.71 
 
 
353 aa  97.4  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0810  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 
314 aa  87.8  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000484628  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4606  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
316 aa  85.9  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.279333  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  24.36 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1877  alpha/beta hydrolase fold protein  25.08 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175585  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4217  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  23.59 
 
 
307 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02210  proline imino-peptidase  24.48 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4540  proline iminopeptidase, putative  23.47 
 
 
316 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0193  alpha/beta hydrolase fold  21.77 
 
 
305 aa  63.5  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  22.48 
 
 
283 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  22.73 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0592  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3951  proline iminopeptidase  32.81 
 
 
322 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  25.26 
 
 
303 aa  60.8  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
240 aa  60.8  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2329  hydrolase, alpha/beta fold family  24.32 
 
 
291 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000968473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  22.48 
 
 
296 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2123  Prolyl aminopeptidase  23.49 
 
 
300 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2042  alpha/beta hydrolase fold  23.69 
 
 
291 aa  59.7  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6197  proline-specific peptidase  24.28 
 
 
300 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.941686 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0279  hypothetical protein  21.27 
 
 
324 aa  58.9  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0626253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  27.68 
 
 
278 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2247  alpha/beta fold family hydrolase  23.47 
 
 
291 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371226  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  21.67 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  24.35 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  25.76 
 
 
264 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  22.3 
 
 
286 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  22.56 
 
 
296 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3126  hydrolase, alpha/beta fold family  21.84 
 
 
301 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.83373  normal  0.0124269 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  23.91 
 
 
312 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1698  prolyl aminopeptidase  23.62 
 
 
320 aa  55.8  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2001  proline iminopeptidase  23.45 
 
 
301 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000475333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2000  proline iminopeptidase  23 
 
 
301 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118293  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.75 
 
 
653 aa  55.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1871  alpha/beta hydrolase fold protein  21.65 
 
 
332 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.725536 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2061  alpha/beta fold family hydrolase  23.1 
 
 
301 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2217  alpha/beta fold family hydrolase  23.1 
 
 
303 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.716655  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0084  prolyl aminopeptidase  28.16 
 
 
318 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0586  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 
285 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.588488  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2245  hydrolase, alpha/beta fold family  23.1 
 
 
301 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1528899999999994e-27 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  24.36 
 
 
287 aa  53.9  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42770  hypothetical protein  27.56 
 
 
327 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  22.88 
 
 
292 aa  53.5  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0600  dipeptidyl peptidase IV  30.95 
 
 
768 aa  53.1  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0141822  normal  0.0367187 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2590  proline iminopeptidase  30.95 
 
 
328 aa  53.1  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5231  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 
293 aa  53.1  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  0.344583 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
344 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 
337 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  23.29 
 
 
291 aa  52.8  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  24.56 
 
 
262 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2199  hydrolase, alpha/beta fold family  21.5 
 
 
291 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0814  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  30 
 
 
765 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000313146  hitchhiker  0.0000639736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3769  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  30 
 
 
768 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000158089  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1149  Acylaminoacyl-peptidase  28.33 
 
 
618 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0889139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  27.81 
 
 
280 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0754  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  24 
 
 
724 aa  51.2  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.125402  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0732  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  27.78 
 
 
748 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0814063  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  24.11 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  27.13 
 
 
315 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  24.36 
 
 
283 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3798  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.05 
 
 
634 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2685  proline-specific peptidase  23.36 
 
 
296 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.492833  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0774  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.03 
 
 
750 aa  50.4  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00925268  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  23.29 
 
 
390 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  25.95 
 
 
678 aa  50.1  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
315 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  21.98 
 
 
297 aa  50.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2907  prolyl aminopeptidase  28.57 
 
 
326 aa  50.1  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2180  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  20.7 
 
 
299 aa  49.7  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2985  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like protein  29.37 
 
 
775 aa  49.7  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 
317 aa  49.7  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  29.19 
 
 
335 aa  49.7  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3642  alpha/beta hydrolase fold protein  24.79 
 
 
412 aa  49.7  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>