26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4780 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4780  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  606  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3331  hypothetical protein  69.26 
 
 
282 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400491  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2390  hypothetical protein  74.31 
 
 
277 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.325647  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3061  hypothetical protein  70.45 
 
 
275 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3562  hypothetical protein  67.55 
 
 
275 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.252373  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1229  hypothetical protein  64.16 
 
 
275 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116233 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3795  hypothetical protein  61.29 
 
 
277 aa  351  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.394583 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4040  hypothetical protein  60.22 
 
 
277 aa  344  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253336  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1669  hypothetical protein  62.26 
 
 
281 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2916  putative hydrolase  57.68 
 
 
277 aa  316  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0078  hypothetical protein  41.96 
 
 
526 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0137812  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1120  hypothetical protein  37.31 
 
 
281 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.381858  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  30.09 
 
 
274 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  42 
 
 
289 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
291 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  58.06 
 
 
504 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  28.1 
 
 
345 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  45 
 
 
340 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  30.3 
 
 
320 aa  42.7  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  45 
 
 
340 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  45 
 
 
340 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  42.5 
 
 
340 aa  42.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0987  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 
312 aa  42.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.460826  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7209  hypothetical protein  24.84 
 
 
373 aa  42.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
340 aa  42.4  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  26.61 
 
 
296 aa  42.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>