94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0673 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0673  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 249 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2876  polysaccharide deacetylase  34.73 
 
 		 257 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1686  polysaccharide deacetylase  33.89 
 
 		 255 aa  148  7e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.0457798 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0390  polysaccharide deacetylase  31.95 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4355  polysaccharide deacetylase  32.22 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.409612  normal  0.738025 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1536  polysaccharide deacetylase  33.47 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2795  polysaccharide deacetylase  24.89 
 
 		 600 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0146758 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2794  polysaccharide deacetylase  27.88 
 
 		 597 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0412434 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  36.17 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  27.4 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  28.08 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2571  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 344 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  26.58 
 
 		 594 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1231  polysaccharide deacetylase  25.93 
 
 		 630 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.534738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  26.71 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  27.4 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 522 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1880  putative polysaccharide deacetylase  27.4 
 
 		 234 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  25.34 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1836  polysaccharide deacetylase  27.4 
 
 		 234 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  26.71 
 
 		 234 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1702  polysaccharide deacetylase  27.4 
 
 		 234 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0924  polysaccharide deacetylase  27.94 
 
 		 173 aa  52.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 271 aa  52  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  28.32 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  25.44 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  27 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  33.33 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  30.63 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2337  polysaccharide deacetylase  37.4 
 
 		 500 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00797389  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1775  polysaccharide deacetylase  27.07 
 
 		 192 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  24.49 
 
 		 291 aa  49.7  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1454  polysaccharide deacetylase  28.36 
 
 		 201 aa  49.3  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0891104  hitchhiker  0.0000678514 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  31.9 
 
 		 898 aa  48.9  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  25.66 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  26.81 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2238  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1762  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  30.97 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6317  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  29.55 
 
 		 299 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  23.91 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0658  xylanase/chitin deacetylase-like protein  28.22 
 
 		 221 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  25.58 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  28 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1451  polysaccharide deacetylase  29.21 
 
 		 337 aa  45.8  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.708112  normal  0.175155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2055  polysaccharide deacetylase  24.66 
 
 		 341 aa  45.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0154503  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  24.79 
 
 		 368 aa  45.8  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4881  polysaccharide deacetylase  28.33 
 
 		 245 aa  45.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5051  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 		 245 aa  45.4  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5436  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 		 245 aa  45.4  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  32.14 
 
 		 373 aa  45.4  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  25.42 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  32.18 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4896  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.434213  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  25.23 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  28.87 
 
 		 488 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0615  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 843 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286732 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3339  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 		 434 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5292  putative polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000730048 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  26.05 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18670  predicted xylanase/chitin deacetylase  27.4 
 
 		 289 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0080  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  26.42 
 
 		 162 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1227  polysaccharide deacetylase  29.46 
 
 		 657 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  26.17 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  32.95 
 
 		 1099 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5636  putative polysaccharide deacetylase  27.83 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000255185 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5368  putative polysaccharide deacetylase  27.42 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000675459  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  36.99 
 
 		 1120 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2522  polysaccharide deacetylase  23.43 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250856  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  32.22 
 
 		 571 aa  43.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5323  putative polysaccharide deacetylase  27.83 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  29.67 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5312  polysaccharide deacetylase, putative  25.83 
 
 		 254 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1834  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 		 397 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 258 aa  42.7  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  26.72 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  30.22 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0677  chitooligosaccharide deacetylase-like  26 
 
 		 267 aa  43.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.457424  unclonable  0.0000000136805 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0823  polysaccharide deacetylase family protein  26.47 
 
 		 305 aa  42.7  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000472378  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1228  polysaccharide deacetylase  22.76 
 
 		 327 aa  42.4  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl558  putative chitin deacetylase  25.43 
 
 		 247 aa  42.7  0.006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  30.61 
 
 		 258 aa  42.4  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  28.72 
 
 		 465 aa  42.4  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5046  polysaccharide deacetylase  29.25 
 
 		 276 aa  42.4  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  27.47 
 
 		 211 aa  42.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  32.18 
 
 		 287 aa  42  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1551  polysaccharide deacetylase  36.05 
 
 		 243 aa  42  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 		 221 aa  42  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  25.69 
 
 		 251 aa  42  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>