94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18670 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_18670  predicted xylanase/chitin deacetylase  100 
 
 
289 aa  589  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  32.19 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  30.45 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  31.01 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  43.21 
 
 
408 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  30.32 
 
 
233 aa  63.9  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  30.32 
 
 
233 aa  63.9  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 
224 aa  63.9  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  27.75 
 
 
319 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  23.81 
 
 
386 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5046  polysaccharide deacetylase  29.36 
 
 
276 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4585  polysaccharide deacetylase  28.94 
 
 
276 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.701791 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  32.19 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  31.2 
 
 
272 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4358  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
265 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  38.3 
 
 
398 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  31.93 
 
 
279 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  25.15 
 
 
261 aa  55.8  0.0000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  28.05 
 
 
322 aa  55.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  30.07 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  39.74 
 
 
398 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  27.7 
 
 
274 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  39.74 
 
 
398 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  22.03 
 
 
322 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1231  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 
630 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.534738  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  29.48 
 
 
271 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  29.11 
 
 
233 aa  52.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  25.12 
 
 
336 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  26.43 
 
 
316 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  30.23 
 
 
274 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  32.2 
 
 
269 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  25.32 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  25.99 
 
 
254 aa  51.6  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  27.82 
 
 
271 aa  51.6  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  25.86 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1454  polysaccharide deacetylase  24.16 
 
 
201 aa  49.7  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0891104  hitchhiker  0.0000678514 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4355  polysaccharide deacetylase  31.97 
 
 
251 aa  49.7  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.409612  normal  0.738025 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  24.03 
 
 
239 aa  49.7  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  24.03 
 
 
239 aa  49.7  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  25.14 
 
 
291 aa  49.3  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0625  polysaccharide deacetylase  24 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0292231  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  31.15 
 
 
321 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  29.24 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1659  polysaccharide deacetylase  36.44 
 
 
429 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243324  normal  0.117174 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  25.24 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  27.15 
 
 
645 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 
337 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  39.74 
 
 
397 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  27.06 
 
 
239 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  27.89 
 
 
289 aa  46.6  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0063  hypothetical protein  32.34 
 
 
363 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1227  polysaccharide deacetylase  32.56 
 
 
657 aa  45.8  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0615  polysaccharide deacetylase  23.88 
 
 
843 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
349 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  28.18 
 
 
316 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3305  polysaccharide deacetylase  29.2 
 
 
411 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  26.77 
 
 
417 aa  45.4  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  24.57 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 
348 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0687  hypothetical protein  31.03 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  28.46 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1536  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 
257 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0673  polysaccharide deacetylase  27.4 
 
 
249 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250144  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2238  polysaccharide deacetylase  40.74 
 
 
289 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  35.9 
 
 
400 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  23.57 
 
 
242 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  28.16 
 
 
244 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  25.55 
 
 
246 aa  43.5  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 
324 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0390  polysaccharide deacetylase  25.68 
 
 
294 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0020  polysaccharide deacetylase  25.27 
 
 
381 aa  43.5  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  28.24 
 
 
289 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1686  polysaccharide deacetylase  27.16 
 
 
255 aa  43.1  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.0457798 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 
244 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  37.74 
 
 
275 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0670  hypothetical protein  29.31 
 
 
286 aa  43.1  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 
244 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  35.9 
 
 
400 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  26.67 
 
 
237 aa  42.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  37.74 
 
 
275 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  33.64 
 
 
350 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  37.74 
 
 
275 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  27.66 
 
 
354 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  40.62 
 
 
322 aa  42.7  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  37.74 
 
 
275 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  29 
 
 
370 aa  42.7  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  37.74 
 
 
276 aa  42.7  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 
270 aa  42.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  37.74 
 
 
275 aa  42.7  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 
598 aa  42.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0908  xylanase/chitin deacetylase  32.81 
 
 
235 aa  42.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1230  polysaccharide deacetylase  27.14 
 
 
482 aa  42.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>