135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3305 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3305  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
411 aa  836    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0727  polysaccharide deacetylase  38.5 
 
 
409 aa  268  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0250  polysaccharide deacetylase  35.97 
 
 
398 aa  237  3e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2647  polysaccharide deacetylase  34.94 
 
 
430 aa  226  7e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.502383  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1899  polysaccharide deacetylase  31.54 
 
 
429 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.557676  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3274  hypothetical protein  29.43 
 
 
430 aa  136  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.864769  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2171  polysaccharide deacetylase  26.91 
 
 
435 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1133  polysaccharide deacetylase  29.59 
 
 
444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3278  polysaccharide deacetylase  32.37 
 
 
444 aa  110  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3294  hypothetical protein  27.76 
 
 
633 aa  87  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4283  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 
600 aa  80.9  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.916194  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  34.71 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  34.71 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  28.75 
 
 
295 aa  72.4  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0020  polysaccharide deacetylase  31.17 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  33.61 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  31.87 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  23.24 
 
 
271 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  37.17 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  31.45 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
282 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  30.18 
 
 
626 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  29.37 
 
 
255 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  26.83 
 
 
249 aa  63.5  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  26.73 
 
 
271 aa  63.2  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  28.97 
 
 
363 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3271  polysaccharide deacetylase  34.94 
 
 
367 aa  62.4  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1796  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 
344 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
336 aa  62  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  29.17 
 
 
357 aa  61.6  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2794  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
597 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0412434 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  32.28 
 
 
258 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 
279 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  31.16 
 
 
262 aa  60.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2698  polysaccharide deacetylase  32.54 
 
 
295 aa  59.7  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000289703  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
238 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  33.33 
 
 
238 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  26.47 
 
 
318 aa  58.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  31.75 
 
 
273 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  29.73 
 
 
590 aa  57.8  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  30.67 
 
 
233 aa  57.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 
316 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 
322 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2522  polysaccharide deacetylase  25.58 
 
 
237 aa  57.4  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250856  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  26.35 
 
 
354 aa  57.8  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 
234 aa  57.4  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  31.11 
 
 
373 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  33.07 
 
 
274 aa  57.4  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  27.34 
 
 
258 aa  57.4  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 
264 aa  56.2  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2112  glycosy hydrolase family protein  29.75 
 
 
320 aa  56.6  0.0000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  31.06 
 
 
233 aa  55.8  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2279  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 
318 aa  55.8  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  31.06 
 
 
233 aa  56.2  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  27.6 
 
 
900 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  33.61 
 
 
627 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2795  polysaccharide deacetylase  29.13 
 
 
600 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0146758 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 
501 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 
510 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  32.23 
 
 
321 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  29.01 
 
 
275 aa  54.7  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  26.36 
 
 
249 aa  54.7  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  27.41 
 
 
903 aa  55.1  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  23.81 
 
 
317 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 
289 aa  54.3  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  29.49 
 
 
349 aa  53.5  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  29.27 
 
 
244 aa  53.5  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  30.09 
 
 
264 aa  53.5  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  28.7 
 
 
291 aa  53.5  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  30.97 
 
 
391 aa  53.1  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 
615 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 
615 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  23.14 
 
 
305 aa  52.8  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0375  polysaccharide deacetylase  28 
 
 
323 aa  52.4  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0881899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0658  xylanase/chitin deacetylase-like protein  35.71 
 
 
221 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  23.42 
 
 
257 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3339  polysaccharide deacetylase  28.26 
 
 
434 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 
352 aa  52.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  37.33 
 
 
318 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
256 aa  51.6  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  25.76 
 
 
898 aa  51.2  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  29.27 
 
 
234 aa  51.2  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 
645 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  28.79 
 
 
251 aa  50.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  25.21 
 
 
290 aa  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  25.21 
 
 
290 aa  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  26.92 
 
 
239 aa  50.1  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 
239 aa  50.1  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  27.64 
 
 
239 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0340  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.45 
 
 
319 aa  49.3  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0441347  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  28.69 
 
 
266 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  37.29 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 
1015 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  30.11 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  28.19 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1802  polysaccharide deacetylase  24.84 
 
 
240 aa  48.5  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  28.89 
 
 
244 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0924  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
173 aa  47.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0890  polysaccharide deacetylase  35.14 
 
 
286 aa  47.4  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.175163  normal  0.871728 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>