33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1899 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1899  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
429 aa  868    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.557676  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2647  polysaccharide deacetylase  53.18 
 
 
430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.502383  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0727  polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 
409 aa  243  6e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0250  polysaccharide deacetylase  36.57 
 
 
398 aa  226  6e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3305  polysaccharide deacetylase  33.42 
 
 
411 aa  221  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2171  polysaccharide deacetylase  24.66 
 
 
435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3274  hypothetical protein  28.57 
 
 
430 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.864769  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3294  hypothetical protein  25.6 
 
 
633 aa  92.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4283  polysaccharide deacetylase  24.93 
 
 
600 aa  82  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.916194  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1133  polysaccharide deacetylase  23.2 
 
 
444 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3278  polysaccharide deacetylase  23.39 
 
 
444 aa  59.7  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  25.6 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  26.06 
 
 
282 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  26.9 
 
 
348 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
1015 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 
336 aa  50.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  27.74 
 
 
319 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 
274 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  25.6 
 
 
348 aa  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  29.86 
 
 
255 aa  47.8  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  23.97 
 
 
305 aa  47.8  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  29.14 
 
 
349 aa  47.4  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  26.19 
 
 
348 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  29.88 
 
 
348 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  33.33 
 
 
306 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
348 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1796  polysaccharide deacetylase  28.32 
 
 
344 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  33.33 
 
 
306 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  24.26 
 
 
348 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  24.4 
 
 
348 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  28.47 
 
 
278 aa  44.3  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
348 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  24.4 
 
 
348 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>