21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3294 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3294  hypothetical protein  100 
 
 
633 aa  1262    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4283  polysaccharide deacetylase  53.67 
 
 
600 aa  608  9.999999999999999e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.916194  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3274  hypothetical protein  30.34 
 
 
430 aa  138  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.864769  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2171  polysaccharide deacetylase  27.3 
 
 
435 aa  103  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2647  polysaccharide deacetylase  28.08 
 
 
430 aa  94.7  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.502383  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3305  polysaccharide deacetylase  28.32 
 
 
411 aa  89.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0627  hypothetical protein  30.11 
 
 
227 aa  89  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0727  polysaccharide deacetylase  30.34 
 
 
409 aa  86.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2555  hypothetical protein  30.41 
 
 
252 aa  86.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1899  polysaccharide deacetylase  24.76 
 
 
429 aa  76.6  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.557676  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3278  polysaccharide deacetylase  25.17 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0250  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1133  polysaccharide deacetylase  24.78 
 
 
444 aa  65.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6583  hypothetical protein  32.48 
 
 
302 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.260944  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2167  hypothetical protein  25.84 
 
 
224 aa  60.8  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2868  putative lipoprotein  26.49 
 
 
240 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000539281  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0580  hypothetical protein  36.36 
 
 
253 aa  50.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.306305  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3464  hypothetical protein  30.91 
 
 
150 aa  48.9  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000205348  hitchhiker  0.00961975 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0151  lipoprotein, putative  26.74 
 
 
424 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5541  hypothetical protein  24.57 
 
 
461 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161942 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3143  hypothetical protein  28.4 
 
 
262 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0512874  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>