21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4283 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4283  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
600 aa  1194    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.916194  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3294  hypothetical protein  54.59 
 
 
633 aa  600  1e-170  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3274  hypothetical protein  32.61 
 
 
430 aa  150  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.864769  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2555  hypothetical protein  33.65 
 
 
252 aa  89  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2171  polysaccharide deacetylase  25.94 
 
 
435 aa  88.2  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0727  polysaccharide deacetylase  28.21 
 
 
409 aa  82.8  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3305  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0250  polysaccharide deacetylase  28.11 
 
 
398 aa  79.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0627  hypothetical protein  30.94 
 
 
227 aa  78.6  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3278  polysaccharide deacetylase  25.4 
 
 
444 aa  72.4  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1133  polysaccharide deacetylase  25.88 
 
 
444 aa  72.4  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2647  polysaccharide deacetylase  25.2 
 
 
430 aa  70.9  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.502383  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2167  hypothetical protein  29.12 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1899  polysaccharide deacetylase  24.1 
 
 
429 aa  67  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.557676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2868  putative lipoprotein  28.23 
 
 
240 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000539281  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6583  hypothetical protein  30.82 
 
 
302 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.260944  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0580  hypothetical protein  26.37 
 
 
253 aa  55.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.306305  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3464  hypothetical protein  29.81 
 
 
150 aa  52.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000205348  hitchhiker  0.00961975 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0151  lipoprotein, putative  25.7 
 
 
424 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5541  hypothetical protein  25.27 
 
 
461 aa  50.4  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161942 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2140  hypothetical protein  31.07 
 
 
273 aa  45.8  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>