11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3274 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3274  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  863    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.864769  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4283  polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 
600 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.916194  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3294  hypothetical protein  29.91 
 
 
633 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3305  polysaccharide deacetylase  29.89 
 
 
411 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2171  polysaccharide deacetylase  26.28 
 
 
435 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3278  polysaccharide deacetylase  28.38 
 
 
444 aa  103  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1133  polysaccharide deacetylase  27.1 
 
 
444 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0250  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 
398 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1899  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 
429 aa  95.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.557676  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2647  polysaccharide deacetylase  26.29 
 
 
430 aa  95.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.502383  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0727  polysaccharide deacetylase  28.65 
 
 
409 aa  90.9  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>