27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1133 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1133  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
444 aa  927    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3278  polysaccharide deacetylase  65.84 
 
 
444 aa  591  1e-168  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3305  polysaccharide deacetylase  29.59 
 
 
411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3274  hypothetical protein  27.59 
 
 
430 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.864769  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0727  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 
409 aa  98.2  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2171  polysaccharide deacetylase  24.49 
 
 
435 aa  87.4  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0250  polysaccharide deacetylase  26.24 
 
 
398 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2647  polysaccharide deacetylase  24.71 
 
 
430 aa  76.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.502383  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4283  polysaccharide deacetylase  25.88 
 
 
600 aa  72.8  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.916194  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3294  hypothetical protein  25.41 
 
 
633 aa  66.6  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  28.22 
 
 
306 aa  60.1  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  28.22 
 
 
306 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1899  polysaccharide deacetylase  25.08 
 
 
429 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.557676  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  24.65 
 
 
305 aa  54.3  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  24.6 
 
 
277 aa  52.8  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3271  polysaccharide deacetylase  40.85 
 
 
367 aa  51.2  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  24.6 
 
 
295 aa  49.7  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
645 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  26.63 
 
 
272 aa  47.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4607  outer membrane N-deacetylase  42.86 
 
 
671 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  26.49 
 
 
348 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  25 
 
 
318 aa  45.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  28.08 
 
 
319 aa  44.3  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  28.36 
 
 
336 aa  43.5  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  25 
 
 
274 aa  43.5  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  24.22 
 
 
256 aa  43.5  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4286  outer membrane N-deacetylase  41.07 
 
 
671 aa  43.1  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>