14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3278 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3278  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
444 aa  908    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1133  polysaccharide deacetylase  66.29 
 
 
444 aa  597  1e-169  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3305  polysaccharide deacetylase  32.37 
 
 
411 aa  109  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3274  hypothetical protein  28.38 
 
 
430 aa  103  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.864769  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2171  polysaccharide deacetylase  24.35 
 
 
435 aa  87.4  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3294  hypothetical protein  25.17 
 
 
633 aa  77.4  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0727  polysaccharide deacetylase  25.91 
 
 
409 aa  72.8  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4283  polysaccharide deacetylase  25.4 
 
 
600 aa  73.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.916194  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0250  polysaccharide deacetylase  25.68 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2647  polysaccharide deacetylase  25.12 
 
 
430 aa  68.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.502383  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1899  polysaccharide deacetylase  23.46 
 
 
429 aa  50.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.557676  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  22.52 
 
 
305 aa  47.4  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  19.84 
 
 
295 aa  43.9  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  24.32 
 
 
348 aa  43.1  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>