67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0727 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0727  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
409 aa  804    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3305  polysaccharide deacetylase  37.29 
 
 
411 aa  250  4e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1899  polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 
429 aa  220  3e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.557676  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0250  polysaccharide deacetylase  38.04 
 
 
398 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2647  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 
430 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.502383  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2171  polysaccharide deacetylase  26.53 
 
 
435 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1133  polysaccharide deacetylase  28.22 
 
 
444 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3274  hypothetical protein  29.31 
 
 
430 aa  90.1  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.864769  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3294  hypothetical protein  30.34 
 
 
633 aa  86.3  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4283  polysaccharide deacetylase  28.21 
 
 
600 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.916194  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3278  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 
444 aa  71.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  29.71 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 
234 aa  65.1  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  30.61 
 
 
306 aa  63.2  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  30.61 
 
 
306 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2295  intercellular adhesion protein B  27.65 
 
 
289 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0572032  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  33.61 
 
 
258 aa  59.7  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 
234 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 
282 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  30.14 
 
 
319 aa  57.4  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  21.84 
 
 
295 aa  56.6  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  31.11 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  29.84 
 
 
233 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 
224 aa  55.1  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  31.11 
 
 
348 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
305 aa  55.5  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  27.22 
 
 
318 aa  54.3  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 
348 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2794  polysaccharide deacetylase  32.03 
 
 
597 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0412434 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  29.75 
 
 
349 aa  53.1  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  28.89 
 
 
348 aa  53.1  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1659  polysaccharide deacetylase  41.89 
 
 
429 aa  52.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243324  normal  0.117174 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  29.33 
 
 
275 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 
1015 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  29.46 
 
 
278 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  29.93 
 
 
348 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  31.9 
 
 
253 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  24.38 
 
 
271 aa  52  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 
626 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  28.89 
 
 
348 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3271  polysaccharide deacetylase  27.41 
 
 
367 aa  50.4  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  31.85 
 
 
348 aa  50.1  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  25.75 
 
 
336 aa  50.1  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  27.34 
 
 
510 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  21.97 
 
 
290 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  21.97 
 
 
290 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  28.89 
 
 
348 aa  49.3  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  29.37 
 
 
255 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 
274 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  33.57 
 
 
321 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2112  glycosy hydrolase family protein  29.85 
 
 
320 aa  46.6  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 
279 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  22.42 
 
 
354 aa  46.6  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2795  polysaccharide deacetylase  23.26 
 
 
600 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0146758 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  28.77 
 
 
289 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  25.53 
 
 
348 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1796  polysaccharide deacetylase  29.11 
 
 
344 aa  44.3  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  28.15 
 
 
272 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0195  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.08 
 
 
407 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0199  polysaccharide deacetylase domain protein  28.08 
 
 
409 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.37766  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  28.4 
 
 
370 aa  43.9  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  23.56 
 
 
256 aa  43.5  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  23.19 
 
 
373 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5874  polysaccharide deacetylase  28.18 
 
 
296 aa  43.1  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199758  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2868  polysaccharide deacetylase  30.84 
 
 
338 aa  42.7  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>