23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3271 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3271  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
367 aa  728    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4606  hypothetical protein  51.64 
 
 
246 aa  232  7.000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2868  polysaccharide deacetylase  32.37 
 
 
338 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3562  polysaccharide deacetylase  35.44 
 
 
388 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2184  polysaccharide deacetylase  32.06 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.573251  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0890  polysaccharide deacetylase  31.29 
 
 
286 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.175163  normal  0.871728 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3305  polysaccharide deacetylase  34.94 
 
 
411 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  35.71 
 
 
306 aa  60.1  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  35.71 
 
 
306 aa  60.1  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  35.37 
 
 
319 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1133  polysaccharide deacetylase  40.85 
 
 
444 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0727  polysaccharide deacetylase  27 
 
 
409 aa  50.1  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1659  polysaccharide deacetylase  38.55 
 
 
429 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243324  normal  0.117174 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0924  polysaccharide deacetylase  43.06 
 
 
173 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  33.33 
 
 
290 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  33.33 
 
 
290 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  24.81 
 
 
265 aa  46.6  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  34.15 
 
 
673 aa  45.8  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2794  polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 
597 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0412434 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2295  intercellular adhesion protein B  32.43 
 
 
289 aa  45.8  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0572032  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
275 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 
336 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  30.38 
 
 
628 aa  42.7  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>