27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0890 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0890  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 286 aa  570  1e-161  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.175163  normal  0.871728 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2184  polysaccharide deacetylase  53 
 
 		 289 aa  296  2e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.573251  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2868  polysaccharide deacetylase  31.93 
 
 		 338 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3562  polysaccharide deacetylase  28.83 
 
 		 388 aa  125  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3271  polysaccharide deacetylase  31.29 
 
 		 367 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4606  hypothetical protein  29.67 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  34.78 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  34.78 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  36.49 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1659  polysaccharide deacetylase  38.96 
 
 		 429 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243324  normal  0.117174 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3305  polysaccharide deacetylase  35.14 
 
 		 411 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  35.53 
 
 		 645 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4607  outer membrane N-deacetylase  29.32 
 
 		 671 aa  46.2  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 		 305 aa  46.2  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  37.04 
 
 		 640 aa  46.2  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  31.51 
 
 		 336 aa  46.2  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  36.71 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8504  polysaccharide deacetylase  37.88 
 
 		 223 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.0143221 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 673 aa  45.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  35.8 
 
 		 624 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  34.25 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2171  polysaccharide deacetylase  34.43 
 
 		 435 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4286  outer membrane N-deacetylase  40 
 
 		 671 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  41.86 
 
 		 276 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  34.15 
 
 		 272 aa  42.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>