178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1659 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1659  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 429 aa  839    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243324  normal  0.117174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  31.87 
 
 		 319 aa  86.7  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  28.08 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  29.68 
 
 		 626 aa  77  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  29.19 
 
 		 275 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  27.49 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  27.49 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  27.37 
 
 		 278 aa  66.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6214  polysaccharide deacetylase  28.17 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0171  polysaccharide deacetylase  26 
 
 		 259 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0521886  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  27.54 
 
 		 673 aa  62.4  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2171  polysaccharide deacetylase  38.96 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0924  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 173 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  28.65 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  30.71 
 
 		 510 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 		 598 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  27.22 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5874  polysaccharide deacetylase  28.23 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  30.71 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4617  polysaccharide deacetylase  33.87 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  30.66 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0020  polysaccharide deacetylase  29.92 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  28.92 
 
 		 283 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  23.59 
 
 		 234 aa  59.3  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  28.34 
 
 		 257 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 		 244 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 		 244 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  27.35 
 
 		 253 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  26.48 
 
 		 348 aa  59.7  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  33.05 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2295  intercellular adhesion protein B  23.3 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0572032  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  27.78 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2795  polysaccharide deacetylase  29.6 
 
 		 600 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0146758 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  27.75 
 
 		 264 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  21.28 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  24.5 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1616  polysaccharide deacetylase  31.37 
 
 		 488 aa  58.2  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  27.16 
 
 		 660 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  27.16 
 
 		 659 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  30.59 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  26.54 
 
 		 659 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  26.71 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  34.15 
 
 		 347 aa  57  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  26.88 
 
 		 348 aa  57  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  25.86 
 
 		 279 aa  57  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  35.51 
 
 		 321 aa  57  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  30.92 
 
 		 289 aa  57  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  38.37 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  29.5 
 
 		 274 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  26.88 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 348 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  35.97 
 
 		 266 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  26.57 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  23.87 
 
 		 349 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  26.57 
 
 		 348 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 348 aa  55.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 348 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  25.27 
 
 		 348 aa  55.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  26.57 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  31.47 
 
 		 269 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  21.76 
 
 		 261 aa  54.7  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0404  polysaccharide deacetylase-like protein  28.87 
 
 		 360 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.606713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0360  polysaccharide deacetylase-like protein  28.87 
 
 		 360 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  29.5 
 
 		 373 aa  53.9  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0298  polysaccharide deacetylase  28.27 
 
 		 360 aa  53.9  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0310  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 		 358 aa  53.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  33.05 
 
 		 594 aa  53.5  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  30.68 
 
 		 628 aa  53.5  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4943  polysaccharide deacetylase-like protein  28.35 
 
 		 360 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  24.32 
 
 		 342 aa  53.5  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  22.43 
 
 		 354 aa  53.1  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  24.43 
 
 		 319 aa  53.1  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 270 aa  53.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5046  polysaccharide deacetylase  28.73 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0377  polysaccharide deacetylase-like protein  27.84 
 
 		 360 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0727  polysaccharide deacetylase  41.89 
 
 		 409 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6390  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 		 238 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0864277 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  26.54 
 
 		 277 aa  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  33.6 
 
 		 271 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4585  polysaccharide deacetylase  28.73 
 
 		 276 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.701791 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4408  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 263 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1233  yggt family protein  24.71 
 
 		 266 aa  51.6  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4541  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 263 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00515582 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  27.63 
 
 		 264 aa  50.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2337  polysaccharide deacetylase  33.6 
 
 		 500 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00797389  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2112  glycosy hydrolase family protein  25 
 
 		 320 aa  50.8  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18670  predicted xylanase/chitin deacetylase  35.94 
 
 		 289 aa  51.2  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.54 
 
 		 258 aa  50.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2794  polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 		 597 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0412434 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  31.72 
 
 		 249 aa  50.4  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  25.31 
 
 		 295 aa  50.4  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0309  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 		 361 aa  50.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  26.9 
 
 		 255 aa  50.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0340  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  23.39 
 
 		 319 aa  50.1  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0441347  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8504  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 		 223 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.0143221 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1231  polysaccharide deacetylase  31.76 
 
 		 630 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.534738  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5605  polysaccharide deacetylase  28.69 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 289 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>