81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0924 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0924  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 173 aa  354  3.9999999999999996e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1659  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 429 aa  61.6  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243324  normal  0.117174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  32.74 
 
 		 319 aa  61.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  30.83 
 
 		 594 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  36.13 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1231  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 630 aa  58.2  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.534738  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  31.97 
 
 		 316 aa  58.2  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 		 282 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3562  polysaccharide deacetylase  40.62 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2794  polysaccharide deacetylase  29.45 
 
 		 597 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0412434 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  30.71 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  30.71 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2337  polysaccharide deacetylase  31.17 
 
 		 500 aa  54.7  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00797389  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  31.5 
 
 		 279 aa  54.3  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0615  polysaccharide deacetylase  30.88 
 
 		 843 aa  54.3  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286732 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  29.92 
 
 		 306 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  25.81 
 
 		 269 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2795  polysaccharide deacetylase  23.85 
 
 		 600 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0146758 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  28.95 
 
 		 277 aa  53.1  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  28.95 
 
 		 254 aa  53.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0673  polysaccharide deacetylase  27.94 
 
 		 249 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  29.13 
 
 		 306 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3554  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 		 630 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  37.5 
 
 		 590 aa  51.6  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  27.87 
 
 		 271 aa  50.8  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 333 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 264 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0390  polysaccharide deacetylase  27.94 
 
 		 294 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  34.12 
 
 		 273 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2698  polysaccharide deacetylase  32.94 
 
 		 295 aa  49.3  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000289703  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  36.51 
 
 		 321 aa  48.5  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1230  polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 		 288 aa  48.5  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00155806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3271  polysaccharide deacetylase  43.06 
 
 		 367 aa  48.5  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  37.14 
 
 		 239 aa  48.5  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2876  polysaccharide deacetylase  31.21 
 
 		 257 aa  48.5  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  38.71 
 
 		 239 aa  48.5  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3305  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 411 aa  47.8  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  32.03 
 
 		 199 aa  47.8  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  32.71 
 
 		 258 aa  47.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  45.76 
 
 		 316 aa  47  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3555  polysaccharide deacetylase  26.88 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  38.81 
 
 		 270 aa  47.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0146  polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 		 266 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  30.08 
 
 		 233 aa  46.6  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0983  xylanase/chitin deacetylase-like  33.88 
 
 		 830 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 		 598 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1230  polysaccharide deacetylase  27.33 
 
 		 482 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4355  polysaccharide deacetylase  29.93 
 
 		 251 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.409612  normal  0.738025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  26.96 
 
 		 291 aa  45.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1476  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 		 353 aa  45.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.412903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2171  polysaccharide deacetylase  26.8 
 
 		 435 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  23.77 
 
 		 295 aa  44.7  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3339  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 434 aa  44.7  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 289 aa  44.3  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  29.27 
 
 		 233 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  47.46 
 
 		 339 aa  43.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  31.9 
 
 		 291 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  31.68 
 
 		 258 aa  43.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  34.29 
 
 		 313 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  41.79 
 
 		 247 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 		 271 aa  43.1  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  28.07 
 
 		 256 aa  43.5  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1227  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 		 657 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2238  polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 		 289 aa  42.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  31.88 
 
 		 234 aa  42  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  39.34 
 
 		 234 aa  42  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1802  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 		 240 aa  41.6  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8504  polysaccharide deacetylase  28.07 
 
 		 223 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.0143221 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  32.53 
 
 		 336 aa  41.6  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  42.37 
 
 		 322 aa  41.2  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 224 aa  41.2  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 645 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  25.89 
 
 		 352 aa  41.2  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1062  hypothetical protein  23.73 
 
 		 268 aa  41.2  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.530433 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0935  polysaccharide deacetylase  25.19 
 
 		 281 aa  40.8  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0476216  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  41.38 
 
 		 244 aa  40.8  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 263 aa  40.8  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 322 aa  40.8  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0727  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 409 aa  40.8  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>