139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3554 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1231  polysaccharide deacetylase  71.97 
 
 
630 aa  838    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.534738  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3554  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
630 aa  1273    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1230  polysaccharide deacetylase  49.58 
 
 
482 aa  422  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0615  polysaccharide deacetylase  51.7 
 
 
843 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286732 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3555  polysaccharide deacetylase  50.36 
 
 
487 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1227  polysaccharide deacetylase  49.57 
 
 
657 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2337  polysaccharide deacetylase  52.51 
 
 
500 aa  260  6e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00797389  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  40.34 
 
 
271 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  37.65 
 
 
269 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  39.53 
 
 
598 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2794  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 
597 aa  82.8  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0412434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2795  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 
600 aa  77  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0146758 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  34.75 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0146  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 
266 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1454  polysaccharide deacetylase  34.13 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0891104  hitchhiker  0.0000678514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3874  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 
281 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  31.58 
 
 
233 aa  68.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  34.71 
 
 
510 aa  67  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  30.83 
 
 
233 aa  66.2  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  28.65 
 
 
253 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  32.31 
 
 
322 aa  64.7  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  33.58 
 
 
255 aa  63.9  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2730  polysaccharide deacetylase  25.6 
 
 
274 aa  63.9  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 
282 aa  63.9  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3339  polysaccharide deacetylase  31.06 
 
 
434 aa  63.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 
251 aa  62.4  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 
233 aa  63.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  31.65 
 
 
264 aa  61.6  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0924  polysaccharide deacetylase  31.85 
 
 
173 aa  62  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  29.1 
 
 
279 aa  62  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  27.86 
 
 
594 aa  61.6  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0232  polysaccharide deacetylase  29.07 
 
 
265 aa  61.2  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.621532  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  27.44 
 
 
278 aa  61.2  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  24.02 
 
 
224 aa  60.1  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  33.06 
 
 
316 aa  59.7  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  28.45 
 
 
319 aa  59.3  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
204 aa  58.9  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 
313 aa  58.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  27.86 
 
 
291 aa  58.2  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  29.66 
 
 
289 aa  58.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  31.06 
 
 
244 aa  57.4  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2723  polysaccharide deacetylase  28.46 
 
 
265 aa  57.4  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 
239 aa  56.6  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0658  xylanase/chitin deacetylase-like protein  30 
 
 
221 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  30.86 
 
 
289 aa  57  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2967  polysaccharide deacetylase  31.62 
 
 
285 aa  55.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000931063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  29.91 
 
 
306 aa  55.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0341  polysaccharide deacetylase  28.19 
 
 
335 aa  55.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1536  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 
257 aa  55.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  28.81 
 
 
254 aa  55.5  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  27.74 
 
 
249 aa  55.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  24.64 
 
 
271 aa  55.1  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  31.9 
 
 
542 aa  55.1  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  29.91 
 
 
306 aa  54.7  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  32.5 
 
 
417 aa  53.5  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  31.5 
 
 
274 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  29.01 
 
 
590 aa  53.5  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  31.67 
 
 
275 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  27.48 
 
 
1748 aa  52.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0853  polysaccharide deacetylase  28.77 
 
 
318 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000296204  normal  0.358313 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  38.1 
 
 
258 aa  53.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  28.16 
 
 
238 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  28.16 
 
 
238 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  26.39 
 
 
261 aa  51.6  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  27.19 
 
 
283 aa  51.6  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  29.71 
 
 
274 aa  51.6  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 
645 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1659  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 
429 aa  51.6  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243324  normal  0.117174 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  27.08 
 
 
257 aa  51.2  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  28.45 
 
 
273 aa  50.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  26.74 
 
 
244 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  26.74 
 
 
244 aa  50.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  26.74 
 
 
244 aa  50.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4585  polysaccharide deacetylase  25.67 
 
 
276 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.701791 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4617  polysaccharide deacetylase  40.28 
 
 
266 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  26.47 
 
 
336 aa  50.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18670  predicted xylanase/chitin deacetylase  30.18 
 
 
289 aa  50.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5046  polysaccharide deacetylase  25.67 
 
 
276 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  38.55 
 
 
316 aa  49.7  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
239 aa  49.3  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 
246 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  36.25 
 
 
292 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1686  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
255 aa  48.5  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.0457798 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 
259 aa  48.9  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  28.57 
 
 
239 aa  48.9  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01852  Chitin deacetylasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.41); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BC78]  27.5 
 
 
249 aa  48.5  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8504  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
223 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.0143221 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3917  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 
259 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3305  polysaccharide deacetylase  30.51 
 
 
411 aa  48.1  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1228  polysaccharide deacetylase  24 
 
 
327 aa  48.1  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5876  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 
265 aa  47.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 
258 aa  47.4  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  20.32 
 
 
234 aa  47.8  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4355  polysaccharide deacetylase  26.29 
 
 
251 aa  47.4  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.409612  normal  0.738025 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0677  chitooligosaccharide deacetylase-like  34.92 
 
 
267 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.457424  unclonable  0.0000000136805 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  28.57 
 
 
277 aa  47  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  24.59 
 
 
320 aa  47  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  32.53 
 
 
217 aa  46.6  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  36.67 
 
 
672 aa  46.6  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>