141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3874 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3874  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 281 aa  552  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0853  polysaccharide deacetylase  51.97 
 
 		 318 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000296204  normal  0.358313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  47.79 
 
 		 598 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  37.74 
 
 		 264 aa  89.4  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  31.56 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  32.76 
 
 		 274 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  32.88 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  28.79 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  30.67 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  30.45 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  27.4 
 
 		 233 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  25.78 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  36.97 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  26.85 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  31.62 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  30.34 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8504  polysaccharide deacetylase  36 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.0143221 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  31.2 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  31.2 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  29.77 
 
 		 626 aa  68.9  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 		 1001 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0792  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  25.12 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  30.88 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  26.5 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  29.1 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0171  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0521886  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  28.05 
 
 		 251 aa  67  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2337  polysaccharide deacetylase  32.69 
 
 		 500 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00797389  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  36.97 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  27.91 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  27.91 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1231  polysaccharide deacetylase  30.71 
 
 		 630 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.534738  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  28.49 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3555  polysaccharide deacetylase  31.79 
 
 		 487 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  28.07 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  24.34 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4585  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.701791 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  27.15 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  26.19 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  27.15 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  26.19 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  35.04 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  27.83 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  25 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3554  polysaccharide deacetylase  29.45 
 
 		 630 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  25 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  22.54 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5046  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  21.88 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0303  polysaccharide deacetylase-like protein  23.98 
 
 		 367 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1014  polysaccharide deacetylase family protein  25.44 
 
 		 417 aa  55.5  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0316  polysaccharide deacetylase-like protein  23.98 
 
 		 367 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0331  polysaccharide deacetylase-like protein  23.98 
 
 		 367 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1227  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 		 657 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1230  polysaccharide deacetylase  31.5 
 
 		 482 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3346  polysaccharide deacetylase family protein  25.44 
 
 		 417 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000257148  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3475  polysaccharide deacetylase  25.44 
 
 		 437 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0363  polysaccharide deacetylase  23.98 
 
 		 367 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0658  xylanase/chitin deacetylase-like protein  30.28 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4358  polysaccharide deacetylase  34.86 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1454  polysaccharide deacetylase  40.37 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0891104  hitchhiker  0.0000678514 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 		 1015 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  26.24 
 
 		 255 aa  53.1  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  29.94 
 
 		 274 aa  52.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 		 234 aa  52.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  27.46 
 
 		 615 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  27.46 
 
 		 615 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 		 426 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  25.45 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  25.45 
 
 		 239 aa  50.8  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 		 407 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  24.79 
 
 		 627 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0020  polysaccharide deacetylase  24.42 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0309  polysaccharide deacetylase  23.49 
 
 		 361 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.87 
 
 		 409 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.87 
 
 		 409 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0360  polysaccharide deacetylase-like protein  23.84 
 
 		 360 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5876  polysaccharide deacetylase  28.45 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  33.64 
 
 		 594 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  25.77 
 
 		 348 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5874  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.37 
 
 		 409 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.2 
 
 		 409 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  24.37 
 
 		 409 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  24.37 
 
 		 409 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0298  polysaccharide deacetylase  23.84 
 
 		 360 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  25.61 
 
 		 363 aa  47  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0310  polysaccharide deacetylase  23.26 
 
 		 358 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  24.37 
 
 		 409 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  36.11 
 
 		 333 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0615  polysaccharide deacetylase  30.07 
 
 		 843 aa  47  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  23.23 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.059566 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>