144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1231 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3554  polysaccharide deacetylase  72.84 
 
 		 630 aa  821    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1231  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 630 aa  1269    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.534738  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1230  polysaccharide deacetylase  52.36 
 
 		 482 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3555  polysaccharide deacetylase  52.77 
 
 		 487 aa  432  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0615  polysaccharide deacetylase  50.61 
 
 		 843 aa  422  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1227  polysaccharide deacetylase  51.14 
 
 		 657 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2337  polysaccharide deacetylase  51.33 
 
 		 500 aa  250  5e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00797389  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  40.95 
 
 		 271 aa  181  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  37.65 
 
 		 269 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  38.52 
 
 		 598 aa  82  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  37.01 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 		 270 aa  73.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0146  polysaccharide deacetylase  27.64 
 
 		 266 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2794  polysaccharide deacetylase  27.93 
 
 		 597 aa  70.9  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0412434 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1454  polysaccharide deacetylase  33.91 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0891104  hitchhiker  0.0000678514 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  29.71 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 		 322 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  29.32 
 
 		 233 aa  67  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0232  polysaccharide deacetylase  31 
 
 		 265 aa  66.6  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.621532  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3874  polysaccharide deacetylase  31.79 
 
 		 281 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2795  polysaccharide deacetylase  31.68 
 
 		 600 aa  65.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0146758 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  28.09 
 
 		 645 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  28.57 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  34.51 
 
 		 542 aa  63.9  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  30.83 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  29.35 
 
 		 594 aa  63.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  29.94 
 
 		 253 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  33.88 
 
 		 510 aa  61.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  28.19 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2730  polysaccharide deacetylase  23.66 
 
 		 274 aa  60.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1536  polysaccharide deacetylase  35.04 
 
 		 257 aa  59.3  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0924  polysaccharide deacetylase  30.25 
 
 		 173 aa  58.5  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  26.26 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  29.3 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 		 255 aa  57  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  27.14 
 
 		 291 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  25.55 
 
 		 234 aa  55.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  31.88 
 
 		 274 aa  56.6  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 282 aa  55.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  26.37 
 
 		 244 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 234 aa  55.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  31.67 
 
 		 417 aa  55.1  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  26.11 
 
 		 244 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  26.35 
 
 		 244 aa  55.1  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  26.11 
 
 		 244 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  28.36 
 
 		 279 aa  54.7  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0390  polysaccharide deacetylase  24.57 
 
 		 294 aa  54.7  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18670  predicted xylanase/chitin deacetylase  29.91 
 
 		 289 aa  54.3  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  29.77 
 
 		 316 aa  54.3  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  28.85 
 
 		 261 aa  53.9  0.000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  26.83 
 
 		 368 aa  53.9  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3339  polysaccharide deacetylase  28.8 
 
 		 434 aa  53.9  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  30.63 
 
 		 274 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  26.45 
 
 		 241 aa  53.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 224 aa  53.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0673  polysaccharide deacetylase  25.93 
 
 		 249 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0658  xylanase/chitin deacetylase-like protein  27.27 
 
 		 221 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  24.1 
 
 		 259 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1907  polysaccharide deacetylase  25.77 
 
 		 282 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  25.98 
 
 		 1015 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  29.6 
 
 		 204 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2723  polysaccharide deacetylase  25.2 
 
 		 265 aa  52.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 		 398 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  34.23 
 
 		 277 aa  51.6  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  26.11 
 
 		 590 aa  51.6  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 		 398 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 398 aa  51.6  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  22.69 
 
 		 1748 aa  51.6  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 289 aa  51.2  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1228  polysaccharide deacetylase  28.07 
 
 		 327 aa  50.4  0.00009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1686  polysaccharide deacetylase  30.84 
 
 		 255 aa  50.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.0457798 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4355  polysaccharide deacetylase  26.89 
 
 		 251 aa  50.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.409612  normal  0.738025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0853  polysaccharide deacetylase  29.1 
 
 		 318 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000296204  normal  0.358313 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  27.54 
 
 		 254 aa  49.7  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  28.49 
 
 		 283 aa  49.7  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0175  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 		 378 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.122625  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  23.58 
 
 		 213 aa  48.9  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  23.58 
 
 		 213 aa  48.9  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  23.58 
 
 		 213 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  23.58 
 
 		 213 aa  48.9  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 		 273 aa  48.9  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  28.21 
 
 		 306 aa  48.9  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  29.31 
 
 		 247 aa  48.5  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  26.75 
 
 		 239 aa  48.9  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  26.75 
 
 		 239 aa  48.9  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0298  polysaccharide deacetylase  28.21 
 
 		 360 aa  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  29.37 
 
 		 256 aa  48.5  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  27.21 
 
 		 336 aa  48.5  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  21.95 
 
 		 217 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4943  polysaccharide deacetylase-like protein  27.35 
 
 		 360 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  23.58 
 
 		 241 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  28.36 
 
 		 246 aa  48.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  28.21 
 
 		 306 aa  48.1  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  25.23 
 
 		 890 aa  48.1  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  26.12 
 
 		 238 aa  48.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  28.69 
 
 		 313 aa  47.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  26.12 
 
 		 238 aa  48.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2876  polysaccharide deacetylase  26.05 
 
 		 257 aa  47.8  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>