41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1907 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1907  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 282 aa  576  1.0000000000000001e-163  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0677  chitooligosaccharide deacetylase-like  38.67 
 
 		 267 aa  168  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.457424  unclonable  0.0000000136805 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0355  polysaccharide deacetylase  37.4 
 
 		 265 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3116  polysaccharide deacetylase  32.54 
 
 		 267 aa  132  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0569329  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3729  polysaccharide deacetylase family protein  31.69 
 
 		 259 aa  120  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6253  polysaccharide deacetylase  31.41 
 
 		 332 aa  115  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.808766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  26.14 
 
 		 594 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  31.29 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  30.23 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  31.48 
 
 		 542 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  26.21 
 
 		 683 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  24.8 
 
 		 271 aa  49.7  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1231  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 		 630 aa  48.9  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.534738  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0615  polysaccharide deacetylase  24.26 
 
 		 843 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286732 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  28.18 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  30.25 
 
 		 289 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  30.56 
 
 		 242 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  31.15 
 
 		 234 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1230  polysaccharide deacetylase  24.54 
 
 		 482 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2571  polysaccharide deacetylase  31.15 
 
 		 235 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  29.92 
 
 		 522 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  38.89 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3555  polysaccharide deacetylase  24.1 
 
 		 487 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  23.47 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3339  polysaccharide deacetylase  23.64 
 
 		 434 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1227  polysaccharide deacetylase  25.78 
 
 		 657 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  27.87 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  34.85 
 
 		 352 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1451  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.708112  normal  0.175155 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  37.1 
 
 		 387 aa  43.5  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  27.87 
 
 		 234 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  27.87 
 
 		 234 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0503  polysaccharide deacetylase  36.76 
 
 		 705 aa  42.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 1154 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  34.15 
 
 		 277 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2723  polysaccharide deacetylase  29.49 
 
 		 265 aa  42.7  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 		 273 aa  42.7  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  30.67 
 
 		 1120 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  28.57 
 
 		 287 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  26.36 
 
 		 261 aa  42.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>