239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3339 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3339  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 434 aa  894    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  31.47 
 
 		 1748 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  33.49 
 
 		 594 aa  79.7  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2337  polysaccharide deacetylase  35.26 
 
 		 500 aa  76.6  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00797389  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 		 258 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  31.51 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  29.89 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  31.97 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  30.28 
 
 		 234 aa  68.9  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  37.21 
 
 		 239 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  29.37 
 
 		 239 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1097  polysaccharide deacetylase  26.18 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  29.8 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0355  polysaccharide deacetylase  27 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  33.61 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  32.33 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  29.55 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  30.67 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  30.58 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  29.93 
 
 		 626 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  29.38 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  34.4 
 
 		 645 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  29.75 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0677  chitooligosaccharide deacetylase-like  27.57 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.457424  unclonable  0.0000000136805 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  31.34 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  30.26 
 
 		 261 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  31.3 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  31.45 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  30.56 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  31.85 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  37.96 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  30.4 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1230  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 		 482 aa  57  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  29.6 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  34.58 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  32.23 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  33.61 
 
 		 267 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0935  polysaccharide deacetylase  30.58 
 
 		 281 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0476216  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 		 247 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0146  polysaccharide deacetylase  30.71 
 
 		 266 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2107  polysaccharide deacetylase  32.33 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 		 274 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 		 241 aa  55.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1231  polysaccharide deacetylase  28.8 
 
 		 630 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.534738  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  31.62 
 
 		 295 aa  54.3  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  34.86 
 
 		 292 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  34.95 
 
 		 542 aa  53.9  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  34.51 
 
 		 318 aa  54.3  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  29.66 
 
 		 294 aa  53.9  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  28.32 
 
 		 263 aa  54.3  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  29.69 
 
 		 260 aa  54.3  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3554  polysaccharide deacetylase  34.13 
 
 		 630 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  32.05 
 
 		 238 aa  53.9  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  32.05 
 
 		 238 aa  53.9  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  30.33 
 
 		 212 aa  53.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  26.38 
 
 		 275 aa  53.5  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 		 234 aa  53.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  30.08 
 
 		 287 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  26.89 
 
 		 259 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0983  xylanase/chitin deacetylase-like  34.44 
 
 		 830 aa  53.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 227 aa  53.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 		 1101 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  27.41 
 
 		 254 aa  52.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0341  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 335 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  27.54 
 
 		 353 aa  53.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 272 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  29.13 
 
 		 217 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  35.14 
 
 		 417 aa  52.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3305  polysaccharide deacetylase  28.26 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  31.08 
 
 		 348 aa  52.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 		 598 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  29.46 
 
 		 199 aa  52.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  28.4 
 
 		 348 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  28.4 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0658  xylanase/chitin deacetylase-like protein  28.45 
 
 		 221 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  28.79 
 
 		 233 aa  52.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  28.4 
 
 		 348 aa  51.6  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3555  polysaccharide deacetylase  27.01 
 
 		 487 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  27.34 
 
 		 261 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  26.61 
 
 		 590 aa  51.2  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0503  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 		 705 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2378  polysaccharide deacetylase  28.81 
 
 		 265 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 305 aa  51.2  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  33.04 
 
 		 204 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  30.7 
 
 		 299 aa  50.4  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 		 627 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 		 354 aa  50.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3076  polysaccharide deacetylase  30.25 
 
 		 265 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112381  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  25.83 
 
 		 256 aa  50.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1098  polysaccharide deacetylase  21.65 
 
 		 380 aa  50.4  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0020  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 381 aa  50.1  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 342 aa  50.1  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  31.67 
 
 		 269 aa  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 		 320 aa  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>