102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2876 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2876  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
257 aa  526  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4355  polysaccharide deacetylase  64.34 
 
 
251 aa  327  9e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.409612  normal  0.738025 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0390  polysaccharide deacetylase  49.22 
 
 
294 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0673  polysaccharide deacetylase  34.73 
 
 
249 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250144  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1686  polysaccharide deacetylase  35.47 
 
 
255 aa  148  9e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.0457798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1536  polysaccharide deacetylase  35.27 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2795  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 
600 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0146758 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2794  polysaccharide deacetylase  25.66 
 
 
597 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0412434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2522  polysaccharide deacetylase  25.4 
 
 
237 aa  56.2  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  33.64 
 
 
322 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  37.14 
 
 
273 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2337  polysaccharide deacetylase  27.15 
 
 
500 aa  52  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00797389  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  33.65 
 
 
242 aa  52  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  20.78 
 
 
234 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  24.79 
 
 
279 aa  50.1  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0615  polysaccharide deacetylase  27.03 
 
 
843 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286732 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3555  polysaccharide deacetylase  25.93 
 
 
487 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  21.24 
 
 
234 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1231  polysaccharide deacetylase  25.58 
 
 
630 aa  49.3  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.534738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0924  polysaccharide deacetylase  31.21 
 
 
173 aa  48.9  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  30.36 
 
 
283 aa  49.3  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  20.35 
 
 
234 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
522 aa  48.9  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  20.35 
 
 
234 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2571  polysaccharide deacetylase  19.47 
 
 
235 aa  48.9  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  20.35 
 
 
234 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  25.46 
 
 
417 aa  48.5  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  33.6 
 
 
404 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1230  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 
482 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  22.22 
 
 
234 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0823  polysaccharide deacetylase family protein  28.03 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000472378  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  26.7 
 
 
387 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1454  polysaccharide deacetylase  30.95 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0891104  hitchhiker  0.0000678514 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  32.69 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  36.05 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 
271 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10309  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B3VP78]  25.33 
 
 
467 aa  47  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0729219  normal  0.0844633 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  31.18 
 
 
237 aa  47  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1702  polysaccharide deacetylase  20.8 
 
 
234 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1836  polysaccharide deacetylase  20.8 
 
 
234 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  39 
 
 
465 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  27.19 
 
 
234 aa  47  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1880  putative polysaccharide deacetylase  20.8 
 
 
234 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  25.69 
 
 
291 aa  46.2  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  24.68 
 
 
269 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  33.33 
 
 
287 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  21 
 
 
291 aa  45.8  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  29.01 
 
 
1099 aa  45.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  30.39 
 
 
503 aa  46.2  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0810  polysaccharide deacetylase family protein  28.03 
 
 
305 aa  45.8  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00210366  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  22.86 
 
 
261 aa  45.4  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  23.01 
 
 
234 aa  45.4  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  29.7 
 
 
251 aa  45.4  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  28.04 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  22.88 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  30.09 
 
 
890 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0146  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  36.11 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  24.24 
 
 
292 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  33.09 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1576  polysaccharide deacetylase  39.13 
 
 
307 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1551  polysaccharide deacetylase  35.44 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  35.37 
 
 
204 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 
537 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  22.39 
 
 
258 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  29.76 
 
 
344 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 
752 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
413 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  28.12 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1227  polysaccharide deacetylase  31.78 
 
 
657 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  28.72 
 
 
273 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  28.72 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  34.44 
 
 
1120 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  37.37 
 
 
280 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  29.35 
 
 
275 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  29.73 
 
 
279 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  29.05 
 
 
267 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1728  polysaccharide deacetylase family protein  28.21 
 
 
238 aa  42.7  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000179283  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
267 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  30.84 
 
 
256 aa  42.7  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  25.23 
 
 
247 aa  42.7  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0143  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 
310 aa  42.4  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.839924  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3066  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 
283 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00688884  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  35.06 
 
 
267 aa  42.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3747  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
245 aa  42.4  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000014318  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  27.14 
 
 
241 aa  42.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  22.47 
 
 
479 aa  42.4  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 
247 aa  42.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  31.65 
 
 
273 aa  42.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 
352 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  27.55 
 
 
307 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  27.66 
 
 
273 aa  42  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 
217 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>