245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2522 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2522  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
237 aa  476  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250856  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  32.19 
 
 
306 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  31.93 
 
 
306 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  27.12 
 
 
278 aa  95.9  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  30.61 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 
279 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 
1015 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  27.76 
 
 
274 aa  85.9  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  27.07 
 
 
282 aa  85.5  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 
319 aa  82  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  29.39 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  28.33 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  26.25 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  24.49 
 
 
289 aa  79  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  29.84 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 
415 aa  75.9  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  25.73 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  27.17 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  27.17 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  25.85 
 
 
659 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.97 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  25.88 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  25.85 
 
 
660 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.51 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.85 
 
 
409 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  28.27 
 
 
409 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  25.97 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  26.77 
 
 
273 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.8 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  33.9 
 
 
295 aa  72  0.000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  31.32 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  25.42 
 
 
659 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  22.01 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  28.35 
 
 
590 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  26.77 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  30.11 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0196  polysaccharide deacetylase domain protein  27.2 
 
 
409 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2698  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000289703  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  26.86 
 
 
407 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.94 
 
 
409 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  31.13 
 
 
594 aa  68.6  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 
322 aa  68.6  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  24.49 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  24.49 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  21.64 
 
 
284 aa  68.6  0.00000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0195  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.2 
 
 
407 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0199  polysaccharide deacetylase domain protein  27.12 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.37766  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  25.42 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  27.43 
 
 
409 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  27.43 
 
 
409 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  23.63 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  27.43 
 
 
409 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  24.34 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  23.14 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  25.91 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  31.55 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  23.63 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  31.55 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  31.29 
 
 
298 aa  67  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  27.43 
 
 
409 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.12 
 
 
258 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  31.11 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  23.14 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  29.83 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  27.43 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  22.36 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  27.06 
 
 
373 aa  64.7  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  23.19 
 
 
289 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  27.87 
 
 
305 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  26.9 
 
 
336 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  25.25 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  26.53 
 
 
357 aa  63.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  27.71 
 
 
234 aa  63.2  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0020  polysaccharide deacetylase  26.49 
 
 
381 aa  63.5  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  27.56 
 
 
363 aa  62.8  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  23.21 
 
 
626 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  27.66 
 
 
627 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  25.52 
 
 
426 aa  62.4  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  27.34 
 
 
256 aa  62.4  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06580  predicted xylanase/chitin deacetylase  26.6 
 
 
629 aa  62  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0792  polysaccharide deacetylase  25.58 
 
 
278 aa  62  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.623292  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  25.82 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0340  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.18 
 
 
319 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0441347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  22.93 
 
 
640 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  25.7 
 
 
349 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1796  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 
344 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2112  glycosy hydrolase family protein  28.16 
 
 
320 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  22.76 
 
 
273 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2295  intercellular adhesion protein B  26.21 
 
 
289 aa  60.1  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0572032  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  22.76 
 
 
273 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  23.46 
 
 
255 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  24.12 
 
 
645 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  22.94 
 
 
348 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  22.51 
 
 
348 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  22.5 
 
 
257 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  22.37 
 
 
348 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  22.94 
 
 
348 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  22.76 
 
 
273 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>