59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1536 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1536  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 257 aa  521  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1686  polysaccharide deacetylase  42.4 
 
 		 255 aa  178  7e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.0457798 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4355  polysaccharide deacetylase  40.37 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.409612  normal  0.738025 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0673  polysaccharide deacetylase  33.47 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0390  polysaccharide deacetylase  34.91 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2876  polysaccharide deacetylase  35.27 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  39.47 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1231  polysaccharide deacetylase  35.04 
 
 		 630 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.534738  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2795  polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 		 600 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0146758 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  35.19 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3555  polysaccharide deacetylase  29.47 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  27.19 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2794  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 597 aa  55.5  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0412434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0628  polysaccharide deacetylase  27.94 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0615  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 		 843 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286732 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  30.56 
 
 		 262 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0646  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 		 275 aa  52.4  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1230  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 		 482 aa  52  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3554  polysaccharide deacetylase  33.96 
 
 		 630 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2055  polysaccharide deacetylase  30.33 
 
 		 341 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0154503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  23.74 
 
 		 204 aa  49.3  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 		 413 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2337  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 		 500 aa  49.3  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00797389  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  24.41 
 
 		 417 aa  48.5  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  23.48 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0408  peptidoglycan GlcNAc deacetylase  26.72 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0146  polysaccharide deacetylase  24.79 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2755  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 		 649 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  22.64 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  26.05 
 
 		 594 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  33.08 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1454  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 		 201 aa  46.6  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0891104  hitchhiker  0.0000678514 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  22.97 
 
 		 387 aa  46.6  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  22.08 
 
 		 279 aa  46.2  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  28.91 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0475  polysaccharide deacetylase  30.63 
 
 		 336 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0117021  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  28.32 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  28.32 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  27.45 
 
 		 1154 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18670  predicted xylanase/chitin deacetylase  28.93 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1476  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 353 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.412903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1227  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 		 657 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  25.22 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  30.23 
 
 		 626 aa  43.5  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  25.45 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2378  polysaccharide deacetylase  28.76 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  28.09 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  25.2 
 
 		 243 aa  42.4  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  31.78 
 
 		 244 aa  42.4  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2571  polysaccharide deacetylase  22.12 
 
 		 235 aa  42.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 		 465 aa  42.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  25.71 
 
 		 253 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 238 aa  42  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  34.67 
 
 		 283 aa  42  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3341  polysaccharide deacetylase  25.32 
 
 		 256 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  18.66 
 
 		 373 aa  42  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>