17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6583 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6583  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  594  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.260944  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0627  hypothetical protein  36.56 
 
 
227 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5541  hypothetical protein  35.2 
 
 
461 aa  93.6  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161942 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2140  hypothetical protein  36.18 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0151  lipoprotein, putative  33.33 
 
 
424 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0580  hypothetical protein  31.8 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.306305  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3464  hypothetical protein  35.26 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000205348  hitchhiker  0.00961975 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2555  hypothetical protein  31.15 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1025  hypothetical protein  32.97 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.995963  decreased coverage  0.00250254 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12440  hypothetical protein  35.1 
 
 
438 aa  67  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.192453  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3294  hypothetical protein  32.48 
 
 
633 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3143  hypothetical protein  33.33 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0512874  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2167  hypothetical protein  26.98 
 
 
224 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4283  polysaccharide deacetylase  30.82 
 
 
600 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.916194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2868  putative lipoprotein  24.17 
 
 
240 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000539281  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0512  hypothetical protein  36.36 
 
 
289 aa  45.8  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2293  hypothetical protein  43.9 
 
 
247 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>