24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1341 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1341  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 379 aa  783    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000820876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0175  polysaccharide deacetylase  53.7 
 
 		 378 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.122625  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0434  polysaccharide deacetylase  35.55 
 
 		 382 aa  229  7e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2055  polysaccharide deacetylase  36.24 
 
 		 341 aa  182  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0154503  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3510  polysaccharide deacetylase  36.97 
 
 		 348 aa  156  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24520  predicted xylanase/chitin deacetylase  34.74 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.417407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0063  hypothetical protein  34.72 
 
 		 363 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1476  polysaccharide deacetylase  30.19 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.412903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2851  polysaccharide deacetylase  29.18 
 
 		 371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000258612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0080  polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2967  hypothetical protein  30.54 
 
 		 363 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  25.82 
 
 		 271 aa  50.4  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1454  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 201 aa  49.3  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0891104  hitchhiker  0.0000678514 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  21.18 
 
 		 256 aa  47.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  22.69 
 
 		 274 aa  46.6  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  26.29 
 
 		 319 aa  46.2  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  29.56 
 
 		 301 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1686  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 255 aa  45.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.0457798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  29.59 
 
 		 269 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0334  hypothetical protein  24.86 
 
 		 463 aa  43.9  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  24.21 
 
 		 322 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0298  polysaccharide deacetylase  25.79 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  27.56 
 
 		 299 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  24.76 
 
 		 289 aa  42.7  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>