17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0894 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0894  parallel beta-helix repeat protein  100 
 
 
755 aa  1519    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1000  Parallel beta-helix repeat protein  38.87 
 
 
710 aa  160  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349147  hitchhiker  0.00938388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0745  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  35.24 
 
 
545 aa  138  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  hitchhiker  0.00012998 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1925  hypothetical protein  28.19 
 
 
401 aa  84  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11551  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4460  hypothetical protein  26.57 
 
 
438 aa  73.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1926  hypothetical protein  27.76 
 
 
266 aa  69.3  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  25.31 
 
 
523 aa  62.8  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6551  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.26 
 
 
303 aa  62  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0186  hypothetical protein  28.09 
 
 
395 aa  60.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0637616  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2522  hypothetical protein  28.67 
 
 
346 aa  58.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165755  normal  0.604183 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2882  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.05 
 
 
939 aa  57.4  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  27.49 
 
 
1278 aa  55.8  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0615  polysaccharide deacetylase  27.02 
 
 
843 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286732 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  26.75 
 
 
835 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0650  hypothetical protein  27.6 
 
 
300 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4483  hypothetical protein  53.85 
 
 
439 aa  44.7  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  38.37 
 
 
1281 aa  44.7  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>