16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1926 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1926  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  529  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1925  hypothetical protein  50.99 
 
 
401 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11551  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  48.46 
 
 
523 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0186  hypothetical protein  33.2 
 
 
395 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0637616  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1000  Parallel beta-helix repeat protein  29.96 
 
 
710 aa  94.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349147  hitchhiker  0.00938388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0745  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  28.46 
 
 
545 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  hitchhiker  0.00012998 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  36.44 
 
 
1278 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6550  hypothetical protein  31.23 
 
 
277 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.236585 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4479  hypothetical protein  32.14 
 
 
355 aa  87  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6551  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.12 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1572  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.57 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0894  parallel beta-helix repeat protein  27.05 
 
 
755 aa  70.1  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0650  hypothetical protein  30.45 
 
 
300 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2522  hypothetical protein  28.57 
 
 
346 aa  59.3  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165755  normal  0.604183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  28.97 
 
 
642 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4483  hypothetical protein  26.84 
 
 
439 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>