10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4483 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4483  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  892    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4489  hypothetical protein  98.08 
 
 
208 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4479  hypothetical protein  49.08 
 
 
355 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1926  hypothetical protein  26.84 
 
 
266 aa  66.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  27.68 
 
 
1278 aa  53.5  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1925  hypothetical protein  22.71 
 
 
401 aa  49.7  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11551  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0745  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  31.18 
 
 
545 aa  46.6  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  hitchhiker  0.00012998 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  27.23 
 
 
523 aa  45.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0894  parallel beta-helix repeat protein  53.85 
 
 
755 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2522  hypothetical protein  21.96 
 
 
346 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165755  normal  0.604183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>