17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0745 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0745  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  100 
 
 		 545 aa  1089    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  hitchhiker  0.00012998 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1925  hypothetical protein  33.24 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0186  hypothetical protein  36.98 
 
 		 395 aa  140  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0637616  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0894  parallel beta-helix repeat protein  36.96 
 
 		 755 aa  128  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  28.7 
 
 		 523 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  35.78 
 
 		 1278 aa  108  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1000  Parallel beta-helix repeat protein  34.35 
 
 		 710 aa  97.8  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349147  hitchhiker  0.00938388 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1926  hypothetical protein  28.46 
 
 		 266 aa  92.8  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6551  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.94 
 
 		 303 aa  90.5  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1572  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.3 
 
 		 319 aa  89  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2522  hypothetical protein  29.89 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165755  normal  0.604183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6550  hypothetical protein  30.45 
 
 		 277 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.236585 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4460  hypothetical protein  28.01 
 
 		 438 aa  72  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0650  hypothetical protein  28.85 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  28.37 
 
 		 642 aa  67.4  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4479  hypothetical protein  26.52 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4483  hypothetical protein  31.18 
 
 		 439 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>