13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6551 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6551  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 303 aa  608  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1572  parallel beta-helix repeat-containing protein  58.68 
 
 		 319 aa  356  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6550  hypothetical protein  56.95 
 
 		 277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.236585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0745  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  31.94 
 
 		 545 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  hitchhiker  0.00012998 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1926  hypothetical protein  30.12 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1925  hypothetical protein  29.18 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  27.73 
 
 		 523 aa  70.5  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1000  Parallel beta-helix repeat protein  27.48 
 
 		 710 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349147  hitchhiker  0.00938388 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0894  parallel beta-helix repeat protein  25.19 
 
 		 755 aa  60.5  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4460  hypothetical protein  24.6 
 
 		 438 aa  56.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1278 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2522  hypothetical protein  24.53 
 
 		 346 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165755  normal  0.604183 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0186  hypothetical protein  24.51 
 
 		 395 aa  43.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0637616  normal  0.177188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>