262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3655 on replicon NC_014214
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  100 
 
 
673 aa  1306    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  34.85 
 
 
932 aa  130  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  32.81 
 
 
919 aa  126  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  29.93 
 
 
946 aa  105  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  35.2 
 
 
416 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  29.82 
 
 
485 aa  88.2  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  30.08 
 
 
424 aa  87.8  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  30.14 
 
 
403 aa  85.9  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  30.14 
 
 
403 aa  85.9  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  25.45 
 
 
694 aa  77.8  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  31.02 
 
 
408 aa  74.7  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  27.47 
 
 
361 aa  74.3  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  27.61 
 
 
784 aa  73.2  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  29.17 
 
 
343 aa  73.2  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  45.33 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  28.92 
 
 
400 aa  70.5  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  22.98 
 
 
1036 aa  70.1  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  37.84 
 
 
441 aa  69.7  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  40.74 
 
 
468 aa  69.3  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  36.36 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  35.77 
 
 
578 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  33.93 
 
 
604 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  37.5 
 
 
639 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  36.13 
 
 
539 aa  62.4  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  28.93 
 
 
330 aa  61.6  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  35.29 
 
 
561 aa  61.6  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  35.29 
 
 
574 aa  61.2  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  35.71 
 
 
543 aa  61.2  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  37.5 
 
 
606 aa  60.8  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3321  S-layer domain-containing protein  28.85 
 
 
492 aa  60.1  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.752822  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3337  S-layer protein  49.02 
 
 
492 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  34.17 
 
 
533 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  35 
 
 
531 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  35.4 
 
 
548 aa  60.1  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3645  putative S-layer protein  49.02 
 
 
492 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3425  S-layer protein  49.02 
 
 
510 aa  59.7  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3386  S-layer protein  49.02 
 
 
510 aa  59.7  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.903804  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  34.17 
 
 
600 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  37.5 
 
 
510 aa  59.3  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3695  s-layer protein  49.02 
 
 
510 aa  59.7  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1629  S-layer protein  29.2 
 
 
470 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00040233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  34.82 
 
 
658 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  37.5 
 
 
513 aa  58.9  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  37.5 
 
 
524 aa  58.9  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  37.17 
 
 
518 aa  58.5  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  34.82 
 
 
629 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  34.82 
 
 
622 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3667  putative S-layer protein  28.1 
 
 
502 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.290497  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1180  S-layer domain protein  33.33 
 
 
220 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0776761  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  30.77 
 
 
186 aa  58.5  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4159  S-layer domain protein  33.33 
 
 
220 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.767768  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  30.5 
 
 
531 aa  58.5  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  34.92 
 
 
643 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1939  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  27.4 
 
 
470 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000781755  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  35 
 
 
491 aa  58.2  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  34.17 
 
 
563 aa  57.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  33.33 
 
 
530 aa  57.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3093  S-layer domain-containing protein  35.29 
 
 
935 aa  57.8  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  33.33 
 
 
572 aa  57.4  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1683  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.86 
 
 
459 aa  57.4  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00306779  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1818  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.86 
 
 
459 aa  57.4  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000545238  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1890  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.86 
 
 
470 aa  57.4  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00294488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1227  S-layer protein, putative  49.15 
 
 
219 aa  57  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  36.44 
 
 
641 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  36.44 
 
 
593 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1285  putative S-layer protein  49.15 
 
 
219 aa  57  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0266369  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  43.64 
 
 
536 aa  57  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1431  S-layer domain-containing protein  38.46 
 
 
458 aa  57  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1863  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  36.92 
 
 
459 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27744e-53 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1065  S-layer protein EA1  38.46 
 
 
859 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000432724  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  36.44 
 
 
591 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  35.34 
 
 
475 aa  56.2  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  32.86 
 
 
528 aa  56.6  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  34.19 
 
 
561 aa  56.2  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  44 
 
 
1208 aa  55.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  40 
 
 
447 aa  55.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  34.17 
 
 
581 aa  55.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  32 
 
 
500 aa  55.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  35.06 
 
 
575 aa  55.5  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  33.33 
 
 
529 aa  55.1  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0790  S-layer protein, EA1 protein  38.46 
 
 
861 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118731  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1028  S-layer protein  49.09 
 
 
220 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.317814  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  34.19 
 
 
514 aa  55.1  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  42.86 
 
 
1226 aa  55.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1208  putative S-layer protein  49.09 
 
 
218 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.447852 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1050  S-layer protein  49.09 
 
 
218 aa  54.7  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76784  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  32.5 
 
 
542 aa  55.1  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1025  S-layer protein  30.77 
 
 
285 aa  54.7  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1031  S-layer domain-containing protein  45.45 
 
 
225 aa  55.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1130  S-layer protein  49.09 
 
 
218 aa  54.7  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1962  putative S-layer protein  39.13 
 
 
331 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000041962 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3843  S-layer domain protein  37.5 
 
 
375 aa  54.3  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  34.26 
 
 
544 aa  54.3  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1926  S-layer protein  37.68 
 
 
331 aa  54.3  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000888894  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  33.33 
 
 
518 aa  53.9  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0842  S-layer protein EA1  36.92 
 
 
862 aa  53.9  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00698001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1787  S-layer protein  37.68 
 
 
344 aa  53.9  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174638  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1744  S-layer protein  36.23 
 
 
332 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000139139  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0887  s-layer protein ea1  36.92 
 
 
862 aa  53.9  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000735579  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0900  S-layer protein  34.62 
 
 
578 aa  53.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000625317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>