125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1591 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  67.23 
 
 		 518 aa  710    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  100 
 
 		 528 aa  1063    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  57.51 
 
 		 531 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  56.51 
 
 		 513 aa  544  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  52.96 
 
 		 543 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  54.36 
 
 		 510 aa  528  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  55.91 
 
 		 500 aa  507  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  49.74 
 
 		 555 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  52.09 
 
 		 561 aa  476  1e-133  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  48.21 
 
 		 524 aa  431  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  47.65 
 
 		 514 aa  428  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  53.42 
 
 		 475 aa  410  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  37.91 
 
 		 515 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  38.21 
 
 		 515 aa  292  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  37.82 
 
 		 544 aa  283  6.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  38.39 
 
 		 543 aa  261  3e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  37.38 
 
 		 531 aa  250  6e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  70 
 
 		 188 aa  246  6e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  36.99 
 
 		 548 aa  238  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  36.57 
 
 		 518 aa  234  3e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  37.69 
 
 		 578 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  34.33 
 
 		 574 aa  223  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  34.92 
 
 		 550 aa  221  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  35.15 
 
 		 533 aa  220  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  32.94 
 
 		 571 aa  216  8e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  33.33 
 
 		 542 aa  212  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  35.11 
 
 		 561 aa  210  5e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  32.99 
 
 		 629 aa  210  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  34.98 
 
 		 539 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  32.25 
 
 		 530 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  33.5 
 
 		 581 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  33.39 
 
 		 531 aa  206  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  33.95 
 
 		 450 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  32.71 
 
 		 491 aa  199  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  32.94 
 
 		 529 aa  199  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  31.81 
 
 		 563 aa  194  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  48.94 
 
 		 658 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  56.22 
 
 		 572 aa  191  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  42.86 
 
 		 643 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  44.72 
 
 		 622 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  33.96 
 
 		 604 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  46.09 
 
 		 639 aa  182  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  45.76 
 
 		 624 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  32.77 
 
 		 606 aa  180  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  31.15 
 
 		 551 aa  180  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  32.63 
 
 		 390 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  31.72 
 
 		 581 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  31.72 
 
 		 581 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  34.01 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  33.42 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  31.73 
 
 		 432 aa  171  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  28.32 
 
 		 589 aa  167  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  32.11 
 
 		 426 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  42.74 
 
 		 666 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  42.74 
 
 		 666 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  30.18 
 
 		 415 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  30.64 
 
 		 586 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  30.64 
 
 		 586 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  29.83 
 
 		 593 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  28.49 
 
 		 600 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  30.13 
 
 		 384 aa  154  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  37.28 
 
 		 641 aa  153  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  28.68 
 
 		 591 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  29.02 
 
 		 437 aa  146  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  29 
 
 		 449 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  35.31 
 
 		 632 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  28.63 
 
 		 508 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  28.4 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  35.44 
 
 		 645 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  30.69 
 
 		 415 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  35.55 
 
 		 568 aa  137  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  42.86 
 
 		 550 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  31.68 
 
 		 440 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  36.76 
 
 		 527 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  27.86 
 
 		 383 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  41.28 
 
 		 261 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  37.36 
 
 		 262 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  37.36 
 
 		 262 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  25.66 
 
 		 431 aa  84  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  25.25 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  25.93 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11511  porin  27.7 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0116362 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0440  porin-like protein  27.15 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  27.18 
 
 		 355 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  32.24 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  31.65 
 
 		 333 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  28.44 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  35.11 
 
 		 485 aa  62.8  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  37.5 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12261  porin  23.55 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  35.35 
 
 		 932 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  31.15 
 
 		 1036 aa  57  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1130  porin precursor-like  25.22 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0788851  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  29.12 
 
 		 336 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  36.46 
 
 		 919 aa  55.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  33.09 
 
 		 673 aa  56.2  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  38.46 
 
 		 408 aa  55.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  35.05 
 
 		 946 aa  54.7  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  31.63 
 
 		 441 aa  54.7  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  27.97 
 
 		 361 aa  53.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>