27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0219 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0217  S-layer domain-containing protein  100 
 
 		 404 aa  786    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0219  S-layer domain-containing protein  100 
 
 		 404 aa  786    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1533  hypothetical protein  28.24 
 
 		 432 aa  95.1  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.135792  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0272  S-layer domain-containing protein  23.42 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0017  hypothetical protein  25 
 
 		 686 aa  67.8  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  23.53 
 
 		 1621 aa  65.9  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  23.31 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  23.31 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  23.97 
 
 		 694 aa  62.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  22.49 
 
 		 468 aa  60.8  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  22.46 
 
 		 1036 aa  56.2  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  25.32 
 
 		 361 aa  53.9  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  28.27 
 
 		 1172 aa  53.5  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0057  S-layer domain-containing protein  22.51 
 
 		 318 aa  53.1  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0140  PKD domain containing protein  19.83 
 
 		 1362 aa  52.4  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  20.06 
 
 		 330 aa  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  22.57 
 
 		 255 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  24.86 
 
 		 1171 aa  49.7  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  23.32 
 
 		 400 aa  47  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1151  hypothetical protein  21.07 
 
 		 386 aa  46.2  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2809  chromosome segregation ATPase-like protein  14.89 
 
 		 2228 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00317  EF hand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02540)  27.21 
 
 		 1258 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1337  hypothetical protein  22.54 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.629526 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1614  Chromosome segregation ATPase-like protein  23.24 
 
 		 1235 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1392  2 domain protein  22.58 
 
 		 252 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1426  hypothetical protein  22.58 
 
 		 252 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.387775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  26.95 
 
 		 424 aa  43.9  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>