118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4440 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  100 
 
 
531 aa  1079    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  69.63 
 
 
529 aa  710    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  50.18 
 
 
533 aa  479  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  47.84 
 
 
542 aa  455  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  48.59 
 
 
563 aa  450  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  47.45 
 
 
581 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  46.42 
 
 
574 aa  442  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  47.22 
 
 
561 aa  444  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  44.14 
 
 
551 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  46.33 
 
 
539 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  47.01 
 
 
550 aa  412  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  43.78 
 
 
639 aa  410  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  45.64 
 
 
491 aa  386  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  41.39 
 
 
572 aa  376  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  44.47 
 
 
530 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  42.5 
 
 
622 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  39.93 
 
 
600 aa  364  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  39.26 
 
 
550 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  40.8 
 
 
604 aa  339  8e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  42.64 
 
 
624 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  40.72 
 
 
571 aa  336  7e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  38.9 
 
 
508 aa  332  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  40.88 
 
 
658 aa  320  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  44.65 
 
 
632 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  44.65 
 
 
645 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  41.13 
 
 
606 aa  300  6e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  37.22 
 
 
593 aa  300  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  37.15 
 
 
591 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  36.79 
 
 
589 aa  290  4e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  33.48 
 
 
666 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  33.48 
 
 
666 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  37.16 
 
 
581 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  37.16 
 
 
581 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  36.83 
 
 
586 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  36.83 
 
 
586 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  37.7 
 
 
543 aa  276  6e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  38.03 
 
 
548 aa  271  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  39.91 
 
 
641 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  37.43 
 
 
531 aa  253  5.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  38.51 
 
 
518 aa  253  6e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  36.48 
 
 
643 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  36.36 
 
 
510 aa  239  1e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  34.51 
 
 
543 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  35.65 
 
 
513 aa  216  5.9999999999999996e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  34.38 
 
 
555 aa  216  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  35.73 
 
 
514 aa  211  2e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  34.31 
 
 
531 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  34.81 
 
 
500 aa  206  9e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  34.21 
 
 
528 aa  206  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  57.87 
 
 
629 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  46.81 
 
 
524 aa  202  8e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  32.42 
 
 
561 aa  201  3e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  34.14 
 
 
518 aa  194  4e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  55.68 
 
 
578 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  32.38 
 
 
568 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  46.12 
 
 
475 aa  185  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  31.38 
 
 
527 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  30.59 
 
 
544 aa  167  4e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  63.57 
 
 
188 aa  158  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  40.11 
 
 
515 aa  116  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  39.25 
 
 
515 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  33.95 
 
 
450 aa  107  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  51.81 
 
 
261 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  39.52 
 
 
262 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  39.52 
 
 
262 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  25.54 
 
 
414 aa  94  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  25.62 
 
 
415 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  23.57 
 
 
437 aa  80.5  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  23.94 
 
 
432 aa  76.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  29.17 
 
 
440 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  24.18 
 
 
432 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  24.87 
 
 
426 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  26.33 
 
 
449 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  35.92 
 
 
485 aa  67.4  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  39.13 
 
 
946 aa  66.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  39.29 
 
 
416 aa  64.7  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  37 
 
 
932 aa  64.3  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  38.39 
 
 
919 aa  63.9  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  26.21 
 
 
431 aa  60.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0779  carbohydrate-selective porin OprB  22.95 
 
 
467 aa  60.5  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000860096  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  35 
 
 
673 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  25.12 
 
 
355 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  34.43 
 
 
424 aa  56.6  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  35.21 
 
 
441 aa  55.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  30.25 
 
 
330 aa  55.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  26.71 
 
 
784 aa  54.3  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  24.63 
 
 
361 aa  54.3  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  30.1 
 
 
255 aa  53.9  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  36.89 
 
 
408 aa  53.5  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  26.29 
 
 
403 aa  53.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  45.28 
 
 
413 aa  53.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  26.29 
 
 
403 aa  53.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  40.43 
 
 
1036 aa  52.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  42.86 
 
 
414 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  39.47 
 
 
558 aa  50.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  27.34 
 
 
400 aa  50.8  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  39.29 
 
 
1821 aa  50.4  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  24.2 
 
 
409 aa  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3271  hypothetical protein  23.37 
 
 
469 aa  49.7  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0437682  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  26.67 
 
 
343 aa  49.7  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>