117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4466 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  65.03 
 
 		 550 aa  640    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  68.5 
 
 		 572 aa  638    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 		 491 aa  1002    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  49.3 
 
 		 542 aa  452  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  50.1 
 
 		 539 aa  439  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  47.67 
 
 		 581 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  45.76 
 
 		 639 aa  409  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  45.84 
 
 		 531 aa  398  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  43.91 
 
 		 563 aa  395  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  44.67 
 
 		 529 aa  379  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  41.88 
 
 		 530 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  43.77 
 
 		 581 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  43.77 
 
 		 581 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  43.19 
 
 		 593 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  42.38 
 
 		 591 aa  360  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  42.2 
 
 		 586 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  42.2 
 
 		 586 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  42.5 
 
 		 574 aa  351  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  42.12 
 
 		 622 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  40.8 
 
 		 589 aa  349  6e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  43.42 
 
 		 533 aa  345  8e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  43.28 
 
 		 561 aa  342  1e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  41.88 
 
 		 624 aa  336  5e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  40.85 
 
 		 658 aa  335  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  40.94 
 
 		 551 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  38.38 
 
 		 508 aa  324  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  37.36 
 
 		 604 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  38.62 
 
 		 571 aa  311  2e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  39.7 
 
 		 550 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  38.19 
 
 		 531 aa  296  6e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  37.77 
 
 		 606 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  37.6 
 
 		 600 aa  289  8e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  37.45 
 
 		 518 aa  289  8e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  36.22 
 
 		 641 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  35.16 
 
 		 543 aa  260  4e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  35.79 
 
 		 548 aa  260  5.0000000000000005e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  34.76 
 
 		 643 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  40.3 
 
 		 645 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  39.65 
 
 		 632 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  35.98 
 
 		 513 aa  238  1e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  35.34 
 
 		 510 aa  232  1e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  32.52 
 
 		 666 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  32.52 
 
 		 666 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  35.73 
 
 		 629 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  34.48 
 
 		 514 aa  220  3.9999999999999997e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  34.2 
 
 		 543 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  34.63 
 
 		 555 aa  213  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  33.72 
 
 		 524 aa  213  7e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  33.66 
 
 		 500 aa  212  2e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  33.39 
 
 		 561 aa  209  6e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  32.76 
 
 		 531 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  34.97 
 
 		 518 aa  208  2e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  32.28 
 
 		 568 aa  206  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  41.49 
 
 		 475 aa  201  3e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  32.71 
 
 		 528 aa  199  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  33.27 
 
 		 527 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  48.33 
 
 		 578 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  36.45 
 
 		 544 aa  162  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  63.41 
 
 		 188 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  26.04 
 
 		 515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  26.57 
 
 		 515 aa  120  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  32.93 
 
 		 450 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  52.44 
 
 		 261 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  60.32 
 
 		 262 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  60.32 
 
 		 262 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  25.73 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  23.26 
 
 		 432 aa  93.2  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  24.4 
 
 		 437 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  26.99 
 
 		 426 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  25.81 
 
 		 415 aa  87.8  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  25.7 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  28.85 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  24.5 
 
 		 449 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  30.89 
 
 		 485 aa  69.3  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  25.41 
 
 		 415 aa  67  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  36.7 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  25.41 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  34.25 
 
 		 946 aa  61.6  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  22.4 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  34.29 
 
 		 932 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  35 
 
 		 673 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  26.78 
 
 		 384 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  32.08 
 
 		 255 aa  55.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  34.95 
 
 		 919 aa  54.3  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  32.37 
 
 		 383 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  41.79 
 
 		 784 aa  53.9  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  24.83 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  30.56 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  42.22 
 
 		 1036 aa  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  30.22 
 
 		 371 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  41.82 
 
 		 413 aa  50.4  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  33.33 
 
 		 330 aa  50.1  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  38.46 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  38.61 
 
 		 408 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  30.38 
 
 		 355 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  36.67 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  38.33 
 
 		 1821 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  34.94 
 
 		 343 aa  48.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  50 
 
 		 548 aa  47.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  31.3 
 
 		 385 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>