84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0023 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  100 
 
 		 568 aa  1147    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  49.21 
 
 		 527 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  42.05 
 
 		 578 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  38.43 
 
 		 629 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  33.85 
 
 		 542 aa  226  8e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  36.33 
 
 		 539 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  32.14 
 
 		 624 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  30.79 
 
 		 551 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  33.02 
 
 		 491 aa  204  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  32.33 
 
 		 563 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  33.52 
 
 		 550 aa  200  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  32.1 
 
 		 530 aa  198  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  31.58 
 
 		 639 aa  196  7e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  32.5 
 
 		 531 aa  195  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  31.55 
 
 		 574 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  32.91 
 
 		 533 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  31.18 
 
 		 571 aa  186  9e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  32.1 
 
 		 548 aa  184  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  30.61 
 
 		 581 aa  183  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  30.19 
 
 		 543 aa  182  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  31.49 
 
 		 643 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  31.22 
 
 		 529 aa  181  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  30.02 
 
 		 550 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  31.86 
 
 		 561 aa  175  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  30.9 
 
 		 591 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  30.54 
 
 		 600 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  30.4 
 
 		 531 aa  170  8e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  32.5 
 
 		 528 aa  168  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  29.48 
 
 		 593 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  30.57 
 
 		 510 aa  167  5.9999999999999996e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  30.34 
 
 		 500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  42.48 
 
 		 572 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  29.47 
 
 		 658 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  29.21 
 
 		 513 aa  161  3e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  31.08 
 
 		 518 aa  160  5e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  28.43 
 
 		 604 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  30.58 
 
 		 543 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  40.15 
 
 		 518 aa  158  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  39.37 
 
 		 606 aa  153  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  27.66 
 
 		 581 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  27.66 
 
 		 581 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  42.08 
 
 		 622 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  32.58 
 
 		 645 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  29.98 
 
 		 514 aa  150  8e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  40.23 
 
 		 641 aa  150  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  28.57 
 
 		 589 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  27.8 
 
 		 586 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  27.8 
 
 		 586 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  33.15 
 
 		 632 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  28.68 
 
 		 508 aa  143  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  28.38 
 
 		 524 aa  142  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  38.19 
 
 		 666 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  38.19 
 
 		 666 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  33.53 
 
 		 531 aa  130  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  34.82 
 
 		 475 aa  126  9e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  32.79 
 
 		 555 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  27.87 
 
 		 561 aa  118  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  29.65 
 
 		 544 aa  116  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  45.04 
 
 		 188 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3661  Carbohydrate-selective porin OprB  26.57 
 
 		 476 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3768  Carbohydrate-selective porin OprB  25.88 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  33.59 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  33.59 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  29.32 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0779  carbohydrate-selective porin OprB  25.6 
 
 		 467 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000860096  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3271  hypothetical protein  25.92 
 
 		 469 aa  72  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0437682  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  36 
 
 		 261 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  32.43 
 
 		 515 aa  68.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  32.07 
 
 		 515 aa  66.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  31.33 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  34.9 
 
 		 426 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  23.38 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  22.72 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  25.4 
 
 		 440 aa  57  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  23.55 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  25.94 
 
 		 383 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  29.17 
 
 		 432 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  25 
 
 		 449 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  28.86 
 
 		 432 aa  50.4  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  39.19 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  25.4 
 
 		 431 aa  48.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  27.1 
 
 		 932 aa  45.8  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  29.09 
 
 		 485 aa  45.1  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1085  Carbohydrate-selective porin OprB  26.92 
 
 		 405 aa  45.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000116954  decreased coverage  8.02155e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>