109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1463 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  100 
 
 		 543 aa  1084    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  76.72 
 
 		 548 aa  801    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  52.89 
 
 		 531 aa  483  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  47.13 
 
 		 518 aa  432  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  41.19 
 
 		 624 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  38.99 
 
 		 574 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  37.07 
 
 		 510 aa  279  7e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  39.96 
 
 		 533 aa  279  8e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  37.61 
 
 		 639 aa  278  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  37.7 
 
 		 531 aa  276  7e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  36.85 
 
 		 513 aa  270  5e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  37.73 
 
 		 500 aa  269  8.999999999999999e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  38.94 
 
 		 543 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  37.96 
 
 		 622 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  38.09 
 
 		 542 aa  266  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  37.84 
 
 		 571 aa  263  4.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  38.07 
 
 		 561 aa  263  6e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  38.39 
 
 		 528 aa  261  3e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  37.21 
 
 		 524 aa  259  8e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  35.21 
 
 		 550 aa  258  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  35.12 
 
 		 555 aa  256  6e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  37.41 
 
 		 539 aa  256  7e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  35.73 
 
 		 563 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  34.78 
 
 		 491 aa  253  6e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  37.07 
 
 		 529 aa  253  8.000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  35.61 
 
 		 514 aa  250  5e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  35.66 
 
 		 531 aa  249  9e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  37.04 
 
 		 518 aa  249  1e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  35.6 
 
 		 658 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  36.43 
 
 		 604 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  35.78 
 
 		 581 aa  244  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  33.45 
 
 		 551 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  33.89 
 
 		 530 aa  237  5.0000000000000005e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  36.82 
 
 		 561 aa  236  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  33.57 
 
 		 581 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  33.57 
 
 		 581 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  35.93 
 
 		 578 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  34.17 
 
 		 641 aa  229  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  32.93 
 
 		 593 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  32.66 
 
 		 586 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  32.66 
 
 		 586 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  34.42 
 
 		 600 aa  220  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  33.99 
 
 		 606 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  34.5 
 
 		 643 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  59.57 
 
 		 572 aa  217  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  35.82 
 
 		 629 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  31.15 
 
 		 591 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  31.91 
 
 		 550 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  40.31 
 
 		 475 aa  198  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  55.91 
 
 		 666 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  55.91 
 
 		 666 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  30.95 
 
 		 589 aa  188  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  28.63 
 
 		 508 aa  182  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  29.12 
 
 		 568 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  33.72 
 
 		 645 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  31.75 
 
 		 632 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  29.76 
 
 		 544 aa  163  8.000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  57.25 
 
 		 188 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  30.83 
 
 		 527 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  28.08 
 
 		 515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  27.92 
 
 		 515 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  26.9 
 
 		 450 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  60.49 
 
 		 261 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  70.49 
 
 		 262 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  70.49 
 
 		 262 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  27.75 
 
 		 426 aa  89.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  27.11 
 
 		 432 aa  88.2  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  24.89 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  28.91 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  25.23 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  28.68 
 
 		 384 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  24.4 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  45.74 
 
 		 485 aa  77  0.0000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  23.81 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  26.01 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  25.65 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  38.79 
 
 		 946 aa  68.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  28.1 
 
 		 449 aa  64.3  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  27.17 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  26.49 
 
 		 415 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  35.71 
 
 		 673 aa  61.2  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  34.21 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  33.33 
 
 		 932 aa  57.4  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  36.46 
 
 		 919 aa  57  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  36.14 
 
 		 255 aa  55.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  31.09 
 
 		 784 aa  52.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  33.33 
 
 		 424 aa  51.6  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  30.82 
 
 		 355 aa  50.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  32.62 
 
 		 371 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  26.32 
 
 		 431 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  29.91 
 
 		 330 aa  49.3  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  36.25 
 
 		 1821 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  35.8 
 
 		 536 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  43.64 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  33.09 
 
 		 186 aa  48.5  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  45 
 
 		 575 aa  48.5  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  42.31 
 
 		 343 aa  48.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  42.22 
 
 		 1036 aa  48.1  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  29.81 
 
 		 441 aa  48.1  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  40.98 
 
 		 414 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>