91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_12591 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  100 
 
 
515 aa  1050    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  93.01 
 
 
515 aa  981    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  40.79 
 
 
514 aa  337  2.9999999999999997e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  40.77 
 
 
524 aa  330  3e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  44.66 
 
 
414 aa  320  3e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  43.41 
 
 
415 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  40.5 
 
 
450 aa  307  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  36.75 
 
 
555 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  37.24 
 
 
528 aa  271  2e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  36.52 
 
 
543 aa  270  5e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  36.64 
 
 
513 aa  266  5e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  37.02 
 
 
531 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  36.4 
 
 
510 aa  263  4e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  34.91 
 
 
432 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  35.48 
 
 
437 aa  249  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  35.51 
 
 
500 aa  240  5e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  34.14 
 
 
518 aa  238  2e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  34.91 
 
 
561 aa  237  5.0000000000000005e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  37.05 
 
 
432 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  37.11 
 
 
426 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  36.34 
 
 
415 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  34.67 
 
 
475 aa  201  3.9999999999999996e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  28.08 
 
 
543 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  51.23 
 
 
188 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  36.84 
 
 
449 aa  140  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  29.21 
 
 
440 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  28.74 
 
 
531 aa  139  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  28.83 
 
 
639 aa  137  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  28.54 
 
 
518 aa  132  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  29.1 
 
 
542 aa  124  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  28.91 
 
 
561 aa  124  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  28.83 
 
 
574 aa  120  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  26.57 
 
 
491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  29.11 
 
 
533 aa  117  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  35.81 
 
 
544 aa  117  6e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  26.54 
 
 
530 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  26.09 
 
 
409 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  27.3 
 
 
390 aa  113  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  37.21 
 
 
548 aa  113  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  39.25 
 
 
531 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  33.2 
 
 
658 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  38.14 
 
 
578 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  28.46 
 
 
384 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  25.64 
 
 
581 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  37.22 
 
 
539 aa  107  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  26.35 
 
 
604 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  38.67 
 
 
572 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  28.9 
 
 
383 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  36.84 
 
 
629 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  37.07 
 
 
622 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  25.5 
 
 
551 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  34.12 
 
 
529 aa  99.8  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  31.71 
 
 
550 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  36.02 
 
 
563 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  30.86 
 
 
641 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  37.71 
 
 
624 aa  97.8  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  36.78 
 
 
643 aa  96.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  37.29 
 
 
571 aa  95.9  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  24.72 
 
 
606 aa  93.6  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  35.63 
 
 
600 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  29 
 
 
591 aa  90.1  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  27.66 
 
 
371 aa  89.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  32 
 
 
589 aa  89.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  32.61 
 
 
593 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  28.68 
 
 
385 aa  88.6  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  30.53 
 
 
645 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  28.19 
 
 
581 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  28.19 
 
 
581 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  27.76 
 
 
586 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  31.97 
 
 
666 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1130  porin precursor-like  25.24 
 
 
384 aa  86.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0788851  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  27.76 
 
 
586 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  31.97 
 
 
666 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  29.65 
 
 
632 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11511  porin  27.35 
 
 
328 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0116362 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  29.44 
 
 
508 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0440  porin-like protein  26.27 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  26.4 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  36.36 
 
 
550 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  25.27 
 
 
335 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  32.37 
 
 
527 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  29.23 
 
 
431 aa  70.5  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  25.54 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  32.43 
 
 
568 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12261  porin  27.35 
 
 
399 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  30.98 
 
 
336 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  41.18 
 
 
355 aa  60.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12251  porin  27.49 
 
 
369 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  30.21 
 
 
261 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  32.35 
 
 
262 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  32.35 
 
 
262 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>