87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1264 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  100 
 
 		 437 aa  891    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  52.89 
 
 		 432 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  52 
 
 		 432 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  49.78 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  41.56 
 
 		 415 aa  296  6e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  44.52 
 
 		 415 aa  290  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  35.8 
 
 		 515 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  36.89 
 
 		 414 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  35.48 
 
 		 515 aa  249  9e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  33.58 
 
 		 524 aa  225  1e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  33.72 
 
 		 514 aa  219  6e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  34.77 
 
 		 371 aa  176  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  31.28 
 
 		 383 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  29.66 
 
 		 531 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1130  porin precursor-like  34.77 
 
 		 384 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0788851  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  26.42 
 
 		 555 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  29.11 
 
 		 518 aa  147  5e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  29.02 
 
 		 528 aa  146  8.000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  26.2 
 
 		 513 aa  143  6e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  28.31 
 
 		 543 aa  143  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  28.36 
 
 		 510 aa  142  9e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  27.55 
 
 		 500 aa  138  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  30.38 
 
 		 385 aa  136  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  28.64 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  28.6 
 
 		 561 aa  126  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12261  porin  30.29 
 
 		 399 aa  119  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  28.77 
 
 		 431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  26.41 
 
 		 450 aa  116  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  27.02 
 
 		 449 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  28.79 
 
 		 440 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  25.56 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  26.77 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  24.94 
 
 		 531 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12251  porin  26.62 
 
 		 369 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  29.51 
 
 		 475 aa  99.4  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  25.66 
 
 		 571 aa  97.8  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  25.59 
 
 		 624 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  25.6 
 
 		 518 aa  92.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  26.01 
 
 		 639 aa  90.5  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  23.74 
 
 		 409 aa  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  24.19 
 
 		 491 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  24.89 
 
 		 543 aa  85.5  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  23.01 
 
 		 581 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  25.83 
 
 		 643 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  25.16 
 
 		 574 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  27.02 
 
 		 550 aa  80.9  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  23.57 
 
 		 531 aa  80.5  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  27.55 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  27.95 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  26.24 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  22.49 
 
 		 589 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  21.46 
 
 		 563 aa  73.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  23.92 
 
 		 561 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  26.04 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  24.33 
 
 		 548 aa  72  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  24.26 
 
 		 578 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  23.42 
 
 		 544 aa  70.1  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  23.45 
 
 		 600 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  32.05 
 
 		 658 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  25.06 
 
 		 539 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  25.7 
 
 		 533 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  33.56 
 
 		 622 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  32.02 
 
 		 542 aa  67  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  30.06 
 
 		 551 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  24.57 
 
 		 508 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  30.99 
 
 		 572 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  31.33 
 
 		 568 aa  63.5  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11511  porin  25.75 
 
 		 328 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0116362 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  28.73 
 
 		 530 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  27.8 
 
 		 586 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0440  porin-like protein  25.95 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  27.8 
 
 		 586 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  28.03 
 
 		 529 aa  58.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  31.03 
 
 		 629 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  22.92 
 
 		 591 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  24.14 
 
 		 581 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  24.14 
 
 		 581 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  28.08 
 
 		 645 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  23.13 
 
 		 606 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  28.08 
 
 		 632 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  35 
 
 		 527 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  35 
 
 		 641 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  26.07 
 
 		 604 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  26 
 
 		 188 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  21.83 
 
 		 593 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  30.21 
 
 		 666 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  30.21 
 
 		 666 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>