92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1122 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  100 
 
 		 261 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  48.12 
 
 		 262 aa  225  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  48.12 
 
 		 262 aa  225  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  71.01 
 
 		 591 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  71.01 
 
 		 593 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  44.44 
 
 		 641 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  71.64 
 
 		 551 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  64.38 
 
 		 581 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  64.38 
 
 		 581 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  46.56 
 
 		 666 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  46.56 
 
 		 666 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  64.71 
 
 		 645 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  64.71 
 
 		 632 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  69.57 
 
 		 548 aa  106  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  60.49 
 
 		 543 aa  106  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  42.52 
 
 		 533 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  68.75 
 
 		 586 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  66.67 
 
 		 586 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  39.1 
 
 		 574 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  72.13 
 
 		 531 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  65.67 
 
 		 550 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  52.38 
 
 		 539 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  42.15 
 
 		 581 aa  102  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  51.81 
 
 		 531 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  61.97 
 
 		 518 aa  101  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  47.87 
 
 		 550 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  45.37 
 
 		 542 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  54.32 
 
 		 529 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  53.09 
 
 		 639 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  50.62 
 
 		 658 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  50.62 
 
 		 624 aa  99.8  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  62.12 
 
 		 561 aa  99.4  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  48.28 
 
 		 572 aa  99.4  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  49.4 
 
 		 578 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  52.44 
 
 		 491 aa  98.6  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  37.32 
 
 		 629 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  51.28 
 
 		 563 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  46.24 
 
 		 622 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  35.95 
 
 		 518 aa  94.7  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  42.34 
 
 		 513 aa  94.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  42.34 
 
 		 510 aa  94  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  53.62 
 
 		 643 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  42.34 
 
 		 524 aa  93.2  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  33.96 
 
 		 604 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  47.5 
 
 		 530 aa  92.8  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  35.16 
 
 		 571 aa  92.8  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  41.44 
 
 		 500 aa  92.4  6e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  41.28 
 
 		 528 aa  92.4  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  41.28 
 
 		 561 aa  92  8e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  41.44 
 
 		 514 aa  91.3  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  41.28 
 
 		 475 aa  91.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  46.32 
 
 		 600 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  44.32 
 
 		 606 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  40.21 
 
 		 544 aa  87.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  40.38 
 
 		 531 aa  85.1  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  40.38 
 
 		 555 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  40.38 
 
 		 543 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  40.38 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  43.04 
 
 		 527 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  36.05 
 
 		 589 aa  76.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  36 
 
 		 568 aa  68.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2359  hypothetical protein  40.66 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0295348  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1650  hypothetical protein  32.08 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.508409  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  38.33 
 
 		 450 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  38.81 
 
 		 508 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  30.21 
 
 		 515 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  30.21 
 
 		 515 aa  52  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  40 
 
 		 536 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  37.93 
 
 		 343 aa  50.4  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  31.96 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2460  hypothetical protein  34.44 
 
 		 133 aa  49.3  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  34.33 
 
 		 400 aa  48.9  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  37.29 
 
 		 441 aa  48.5  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  34.33 
 
 		 400 aa  48.5  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  36.84 
 
 		 361 aa  47.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  41.51 
 
 		 186 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  33.33 
 
 		 506 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  35.19 
 
 		 784 aa  45.8  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  48.94 
 
 		 946 aa  45.8  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  29.79 
 
 		 1036 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  32.79 
 
 		 330 aa  44.7  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  43.75 
 
 		 548 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  42.86 
 
 		 575 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  32.31 
 
 		 468 aa  43.9  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  46.67 
 
 		 408 aa  43.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  35.09 
 
 		 413 aa  42.7  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  33.93 
 
 		 1821 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  37.29 
 
 		 673 aa  42.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  35.42 
 
 		 403 aa  42.4  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  35.42 
 
 		 403 aa  42.4  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  42.22 
 
 		 919 aa  42.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  45 
 
 		 457 aa  42.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>