111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1464 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  100 
 
 		 531 aa  1069    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  68.43 
 
 		 518 aa  694    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  52.89 
 
 		 543 aa  483  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  49.38 
 
 		 548 aa  456  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  39.44 
 
 		 624 aa  288  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  37.6 
 
 		 491 aa  289  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  37.06 
 
 		 510 aa  282  8.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  37.48 
 
 		 542 aa  280  5e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  38.97 
 
 		 543 aa  279  7e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  36.4 
 
 		 514 aa  278  2e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  36.71 
 
 		 513 aa  275  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  36.6 
 
 		 500 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  36.31 
 
 		 524 aa  273  5.000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  37.89 
 
 		 539 aa  273  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  37.91 
 
 		 533 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  38.15 
 
 		 561 aa  266  5.999999999999999e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  37.31 
 
 		 572 aa  266  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  36.49 
 
 		 555 aa  264  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  36.15 
 
 		 581 aa  263  6e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  37.45 
 
 		 574 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  35.49 
 
 		 622 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  33.96 
 
 		 550 aa  259  8e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  35.95 
 
 		 563 aa  256  7e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  36.05 
 
 		 571 aa  255  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  36.05 
 
 		 658 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  36.61 
 
 		 531 aa  253  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  37.2 
 
 		 528 aa  250  5e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  35.21 
 
 		 529 aa  248  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  34.62 
 
 		 561 aa  248  2e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  35.2 
 
 		 530 aa  247  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  35.63 
 
 		 518 aa  246  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  35.06 
 
 		 531 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  33.91 
 
 		 551 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  33.27 
 
 		 581 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  33.27 
 
 		 581 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  33.09 
 
 		 604 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  35.6 
 
 		 643 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  50.81 
 
 		 639 aa  228  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  32.22 
 
 		 586 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  32.22 
 
 		 586 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  33.4 
 
 		 593 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  35.82 
 
 		 629 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  32.51 
 
 		 591 aa  216  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  34.51 
 
 		 578 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  43.79 
 
 		 641 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  36.6 
 
 		 475 aa  209  7e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  32.41 
 
 		 606 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  46.25 
 
 		 666 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  46.25 
 
 		 666 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  29.55 
 
 		 589 aa  195  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  30.05 
 
 		 600 aa  190  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  29.34 
 
 		 508 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  29.34 
 
 		 544 aa  175  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  52.66 
 
 		 645 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  50.86 
 
 		 632 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  50.85 
 
 		 550 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  54.04 
 
 		 188 aa  163  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  29.87 
 
 		 515 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  29.31 
 
 		 515 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  34.78 
 
 		 568 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  41.35 
 
 		 527 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  27.12 
 
 		 450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  51.67 
 
 		 262 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  51.67 
 
 		 262 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  29.38 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  50.46 
 
 		 261 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  29.31 
 
 		 432 aa  103  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  24.94 
 
 		 437 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  27.32 
 
 		 415 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  30.11 
 
 		 440 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  28.47 
 
 		 432 aa  93.6  8e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  26.27 
 
 		 414 aa  91.3  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  25.42 
 
 		 449 aa  91.3  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  33.16 
 
 		 485 aa  81.6  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  26.16 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  37.93 
 
 		 946 aa  68.6  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  26.3 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  25.67 
 
 		 385 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  25.77 
 
 		 255 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  26.35 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  24.81 
 
 		 390 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  23.9 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  30.5 
 
 		 673 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  33.33 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  25.63 
 
 		 355 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  25.49 
 
 		 383 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  31.31 
 
 		 932 aa  53.9  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  34.38 
 
 		 919 aa  53.9  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  28.86 
 
 		 431 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  30.77 
 
 		 330 aa  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  26.24 
 
 		 784 aa  52  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  43.64 
 
 		 413 aa  50.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  36.62 
 
 		 1821 aa  50.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  41.18 
 
 		 575 aa  50.4  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  41.38 
 
 		 414 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  31.48 
 
 		 424 aa  48.5  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  40.38 
 
 		 343 aa  47.8  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  42.22 
 
 		 1036 aa  47.8  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  35.71 
 
 		 536 aa  47  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  30.23 
 
 		 333 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>