106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4536 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  100 
 
 
624 aa  1254    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  69.71 
 
 
571 aa  830    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  53.62 
 
 
643 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  45.49 
 
 
563 aa  389  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  42.93 
 
 
533 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  43.01 
 
 
542 aa  369  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  42.12 
 
 
581 aa  365  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  43.45 
 
 
539 aa  361  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  44.11 
 
 
574 aa  347  4e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  40.78 
 
 
622 aa  347  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  42.64 
 
 
531 aa  337  5e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  42.72 
 
 
561 aa  332  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  38.53 
 
 
639 aa  330  7e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  41.7 
 
 
491 aa  325  1e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  39.19 
 
 
550 aa  321  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  41.24 
 
 
529 aa  320  3.9999999999999996e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  42.31 
 
 
530 aa  317  6e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  39.27 
 
 
658 aa  303  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  37.03 
 
 
572 aa  296  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  41.19 
 
 
543 aa  291  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  39.44 
 
 
531 aa  288  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  38.86 
 
 
548 aa  281  2e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  35.65 
 
 
604 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  34.94 
 
 
606 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  35.24 
 
 
550 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  35.19 
 
 
591 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  36.71 
 
 
518 aa  253  5.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  34.34 
 
 
586 aa  251  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  34.34 
 
 
586 aa  251  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  33.52 
 
 
551 aa  249  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  33.33 
 
 
508 aa  249  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  33.88 
 
 
600 aa  249  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  34.59 
 
 
581 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  34.59 
 
 
581 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  37.25 
 
 
578 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  34.29 
 
 
593 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  31.69 
 
 
589 aa  238  3e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  32.95 
 
 
641 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  32.62 
 
 
666 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  32.62 
 
 
666 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  34.32 
 
 
510 aa  222  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  35.29 
 
 
518 aa  220  6e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  32.89 
 
 
543 aa  209  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  33.88 
 
 
513 aa  207  4e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  31.47 
 
 
524 aa  207  5e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  33.28 
 
 
561 aa  206  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  30.82 
 
 
555 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  33.46 
 
 
500 aa  202  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  33.85 
 
 
531 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  32.88 
 
 
645 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  35.07 
 
 
632 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  46.71 
 
 
629 aa  200  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  31.24 
 
 
568 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  43.06 
 
 
475 aa  188  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  45.76 
 
 
528 aa  181  4e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  39.42 
 
 
514 aa  179  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  39.77 
 
 
544 aa  158  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  39.05 
 
 
527 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  54.17 
 
 
188 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  40.12 
 
 
515 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  50.62 
 
 
261 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  30.47 
 
 
450 aa  99.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  37.71 
 
 
515 aa  97.8  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  54.41 
 
 
262 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  54.41 
 
 
262 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  25.59 
 
 
437 aa  92.8  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  25.05 
 
 
432 aa  89  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  26.13 
 
 
426 aa  87.8  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  24.08 
 
 
432 aa  74.7  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  28.51 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  40.4 
 
 
946 aa  63.9  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  31.01 
 
 
485 aa  63.5  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  24.47 
 
 
415 aa  61.6  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  30.26 
 
 
415 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  24.92 
 
 
449 aa  58.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  36 
 
 
932 aa  57.8  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  31.09 
 
 
416 aa  55.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  29.87 
 
 
414 aa  53.9  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  36.73 
 
 
919 aa  53.5  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  35 
 
 
673 aa  51.2  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  27.6 
 
 
431 aa  50.8  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  29.63 
 
 
361 aa  50.4  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  23.75 
 
 
390 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  29.06 
 
 
330 aa  49.3  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  29.52 
 
 
384 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  28.85 
 
 
186 aa  48.9  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2751  carbohydrate-selective porin OprB  29.63 
 
 
446 aa  48.1  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.202947  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  30.1 
 
 
255 aa  48.1  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  32.99 
 
 
558 aa  47.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  33.87 
 
 
441 aa  47.8  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  23.88 
 
 
409 aa  47.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  30.84 
 
 
343 aa  47  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  36.25 
 
 
784 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  40 
 
 
1036 aa  46.2  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  37.5 
 
 
400 aa  45.8  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  45.28 
 
 
575 aa  46.2  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  33.98 
 
 
408 aa  45.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  29.11 
 
 
424 aa  45.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  38.89 
 
 
1821 aa  45.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0779  carbohydrate-selective porin OprB  30 
 
 
467 aa  44.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000860096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>